Basic Information
Symbol
hsa_ABCA1_0003600
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0087809
hsa_circABCA1_016
Host gene
ABCA1
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
9:107562100-107588168
UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
9:104799819-104825887
UCSC (hg38)
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-903.50 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-955.77 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
587.70
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((.(((((.((...((((..(((((((((((((((((....((((...((((((.((((..(((((((((.(.(((((((..((..((((((((((((((.((((((((((.(((...........)))))))...))))))..(((((((((.((((..((.....))))))........(((((((.((((((...((((((((......((((((((((((((((.(((((((((((((..((((.((....))))))))))))))))).)).)).(.(((((((.(.((((((.((.(.(((...((((((...((((.(((((.(.(...((((.(........).))))).).))))).))))..))))))....))).).).).)))))).).))))))).)....)))))))....)))))))..(((((.((((.((((((((((.((.((((((..((((((((((..(((((((.(...((((....)))).))))))))..)))))..)))((((...)))).......(((.........((((((((((((...(((((.((((((((..((((((......))))))....(((((((..((((((.......))))))(((((.......)))))..((((........)))).((((((((((((((((.(((.((((((((.((....((((.....(((((((((((......))))(((....)))....((.(((((((((..(((...((.(((((...((.((((..(((((((((....)))))))..))..)))).))..))))).))..))).))))))))).))..(((.((.((((....)))).)).)))(((....))).....))))))).)))))).)))))..))).))).))).((((((((....(((.....((((((((((..((....))....))))))).)))..)))...))))))))..((((..(((.(((....))).)))..))))((((((((((((.((((....)))).......((((((((.........))))).)))......)))))))).))))(((...(((.....)))..))).)))))))))))))...((((((((.(((....(((((.(((..(((..((.(.....).))..)))..))).)))))....)))....))))))))))))))).))))....)))).)))))..(((((((((.((.....)).))))))).))((((((.((((.((((.(((.(((((((.((((.((.(((......))).)).))))..)))))))...))).))))))))....))))))))))))))).)))))).((((......)))).))..))))))..)).))).)))))))...))).).)))))...(((((.(((((((....((((..(((((((((..(.(.(((((((((.(((((((((((.........))))))(((.((....(((((...((((((((........(((...((((..(((.((....)))))..)))).))).((((((((((((((.(((.(.(((.(((((.(((((...........))))).))))).)))).))).)).)))).))..))))))..))))))))....)))))....)))))...........))))).))))))))).))..)))).........))))).))))........))))))))))))...))))))))...))).))).)))))))..))))))))).......((((....))))..(((((......))))).....)).))))))))))..((((.((......((((((...(((.....(((...(((.((....))..)))))).....))).))))))...)))))).))..))..)))))))))))))...((((.((((..((((.....))))..))))...))))...((((((..........))))))(((((.((((((.(..(........)..).))))))))).))(((((((.......))))))).)))).)))).))))))...))))...(((((.((((.((((...(((.((.((...(((....)))...)).)).)))))))..)))).))))).))))))))))).......(((......)))((((((.((((....((((((((((.((((((((.(((((((.((((..((..(.((((.....)))))..)).)))).))))))).(((......))).............(((((((..(((((((((((((((((...(((((((....)))))))))))..)).)))))))).(((((..............)))))...........(((((((((.......)))))))))....(((((.(((.....))).)))))))).)))))....))...))))))))...))..)))).........))))...)))).))))))))))))..))))..))))))))))...((((....))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
((,{((((({,{..,{(({,{(((((((((((((((((....,{((,,{(({,,{|||{|||(((.(((((.(.(((((((..((.,((((((((((((((,(((((((((({((((.{({.....{((.....))).....))}.}}|||,,.....|}})}))}}}}||{{,...,,,,.(((((((.((((((...((((((((......{(((((((((((((((.(((((((((((((,(((((.{{...,)))}}}))))))))))).)).)).{.(((((((.(.((((((.({.(.(((...((((((...((((.(((((.(.{...({({,(,,......}.))))}.).))))).))))..))))))....))).}.}.).)))))).).))))))).}....)))))))....))))))}..(((((.{((({(((((((((({{(.((((((..{(((((((((..(((((((.{...((((....)))).})))))))..)))))..}}}((((...))))...{((.(((.........((((((((((((.(((((((((((((,,...{{(((({.,,,}))}|||({{...})))|,(((((((.,....,)))))))...,.((((({,((((((..((((((...,.{(((({...}),})).).}..))))))..))))))))))))}}||.}}}}|(((((((((......))))|||},...,,...,{.{{{||||{.|{,{((({..{(.((((({.......{(((((({(({(((({((({({{|||,{||{|,..{{{{|,,,}))},.,||{((,,.,,|}}}}.(((.{{.((((....)))).}}.))){((....))),.....,},,)))))))))}..,...})})))),.,,}})),|{{{({{((.,.((.,((((((.....))))))..)).}}})),,}}}}))}.})))).)))}}((.(((((.{((((((.(((.....((((((((((.{(((((((((((,(({{....|}||.{,,.,.,(.(((,,..}}}}.,.}))),,}}},...}})))))))).)))},{{...(((.....))),|||},....},}{((({{(((({((((((.|((..,,(((((.(({,,(({..((,,..,,,).}),.))}.,))).))))}....))).,,.))))))}.,)).))).))))}..))))))))))...))).)))))).,.))))).))....)))))((((((.((((.((((.(((.(((((((.((((.((.(((......))).)).))))..)))))))...))).))))))))....))))))))))))))).)))))).))}.,.....,}}}.)}..)))))).,,).))).)))))))}}.))).}.)))))...((((,,(((((((...,((((..(((((((((..,.(.(((((((((.(((((.,.....(((((((((((.{.,,,.,(((((,.((.....(((((((.........)))))))..},.}).)))..,,}))))))))})))).,((((({(((((((.(((.,.(((,(((((.(((((...........))))).))))).)))).))).)).)))).)}..)))))|(((((((.((((({....)))))))))....))))}.,.))))).))))))))).),..))))..,....,.))))).)))).,......,)))))))))))...))))))))...)))}}}).)))))))..||,,}}}},......|||{{{{,..,,))}{((((......))))}...,.)),})))))))))..((((.((......((((((...(((...,,{((,.,(({.((....))..)})))},},,}))).))))))...)))))).}).,))..))))))))))))).}}|,...((((..((((.....))))..))))..(((((.(,{(((((..........)))))))))))),{{(((,(..{........,..).))))))||,,.{(((((...)))))}|)|))))}})))))))}.,}}}}....,,,....(((((.((((.(((({..,{{.((.,{,,.{{,....)))...,,.)).)))))))..)))).))))).)))))))))),,}}}}}}}|..,.,{{{|.((((((.((((,...(({(((((((.((((((((.(((((((.{{{{{{({..,.{{{{.....)))),..}},))},.))))))).{{{......}}}........}}...{,(((((..(({((((((((((,{{,..,(((((({....})))))))})}..)).)))))))).(((((..............))))).{{{......,(((((((((.......)))))))))....(((((.(((.....))).)))))})).))))).,,,},...)))))))}..,)}..)))),....,....,}}...)))}.)))))))}})))}})))),..)))))))))...((((....))))
Forensic Context
No forensic context available.