Basic Information

Symbol
hsa_FAT3_0012500
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-FAT3_0061
Host gene
FAT3
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
11:92564788-92600375 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
11:92831622-92867209 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-975.10 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -1022.71 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 630.53
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((...((((.((........)).))))((((.((((((((((((((....)))))))..((((((.((.(((.(((((((.((((.((((((.(((((((((((((..((((.(((((((.........)))))))..)))).((((....))))..((((((..(((((((.(((...(((((......((.....)).......)))))........)))...)))))))))))))((((((((((((((((...)).)))).((((.(((((...(((((((..(((((((((.....)))))))))...(((((((.((((((((.....))))))...(((((((((.(.....(((((......(((...(((((.......)))))...))).)))))...))))))))))...............((...(((((((.(((((..((((.((.(((((((......)))))))...)).))))..(((((.((((((((.((...)).))).((((((...(((((.......((((((.(((((.((.((.......)).)).))))).)))))))))))....))))))((((((...)))))).))))).)))))(((.((..(((((((.((((...((((((((...))))))))..(((((.............(((((((((((((((..(......................)..))))).))))).))))).(((((..(((((.(((((((((((((...((((((((.....))))))))...))))..((((...((((.(((((...))))).))))...))))((((((((((((..............(((((.(((((((((.((((.(((((((.(.(((((((........))))))).).))...(((((((((.............(((((.(((((((((((.........))).)))))))))))))....(((((((((.((.((...((((....))))...)).))...)))))))))..)))))))))..(((((((((.((.(((..((((..(((((..((......)).((...(((((((.((((.(((....))).))))...))))))).)).((((...((((.((.(((.......(((((...(((((.((......)).))))).))))))))))))))...))))..))))).))))...))))).)))))))))..)).)))...))))..)))).))))).)))))...............)))))))....((((((.....))))))..))))).))))))))))))))..)))))))))))))).)))))))..).).)))))))).))))))).))..((((((((((((((.(((((..((...(((((.((.(((((.((((....(((((.....(.(((((........((((.....))))...(((((((((((..((((.((((........))))))))...)))))))).)))...))))).)))))).)))))))))..((((((((((....(((......))).....)))))..))))).((((.(((......))).))))(((((...(((((((.......((..((((((.((((....((((..........................))))..))))..)).))))..))...((((((..((((..((....))..))))....)))))).))))))).))))).....)).)))))..))..)))))))))))).))))))))))))))))...((((((((....))))))))((((((....)))))))))))))))))).))))((((((((...)))).))))...((.((((((...)))))))).(((((((((((((((.((...((((((((((......(((((((.(((.((((.((((((.((((((((((...)))))...))))).)))))).))))....(((((....((((.((..(((((((....))).))))..))..)))).....)))))....(((((((((...((((.......((((((....(((........)))))))))))))...))).))))))(((.((((((..((((((((((.....)))))))))).(((((((.(((..........))).))))))))))))).)))..))).)))))))..))))).)))))..)))))..(((...(((((((((.((((.......))))))).)))))))))((((((((((((...((((((.(((..((...)).))).))))))..........))))))).)))))..((((((...))))))....))))))))))))..))))).)))))))))).)))..))))))))))))))).(((.((((...............((((((((((........))))..)))))))))).))))))))))))).))..)))))).)))))))))))))))((...(((((...((((....))))((((((....))))))(((((..((....))))))).)))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((...((((.((........)).))))((((.((((((((((((((....)))))))..((((((.((.(((.((((((((((((.((((((.(((((((((((((,.((((.(((((((.........))))))}..)))).((((....))))..((((((,.{((((((.,((.{,(((((..,...((,...,)).......)))))........))),..))))))))))))){(((((((((((((((.,.||,}}}},||{{,|||||,,,(((((((,,(((((((((.....))))))))}..,(((((,,,((((((((.....)))))|,..(((((((({,(.....(((((......{((...{((((......,)))}}..,)}}.)))))...))))))))))..},...........((,..{{{||((,(((({..((({.,{.(((((((......)))))))...}},)}}),.{((((,(((((.........)},)),.{(((((...(((((.......{(((((.(((((.((.((.......)).)).))))).)))))))))))....)))))|((((((...)))))),))))}.|||||((({({{.{((((((.((((...((((((({...}))))))},,(((((,..........,.(((((((((((((((..(,,....................)..)))))},)))).))))).|((((..(((({{(((((((((((((...((((((((.....))))))))...))))..{(((,..((((.((({{...))))).)))),,.})))(({((((,,,,|}}}......,,...(((((.(((((((((.{(({.((({,((.(.(((((((........))))))).).))...(((((((((,,..,.....}}.((({(((((((((((((.........)))})))))))))))))....(((((((((.{{.((,{{((((....))))..})),))...)))))))))..)))))))))..(((((((((.({.(({..((((..((({(,.{(,...,,||.{(...(((((((.((((.(((....))).))))...))))))).}}.{{{{...{(((.{,,{{{....,..(((((...(((((.((......)).))))).)))))}))))))))...))))..))})).))))...})))}.)))))))))..}}.)))...))))..)))))}}))).)))))...,}.,........||||,},.,,,|(((((.....))))))..))))).))))))))))))))..)))))))))))))).)))))))..|||.|}}})))},|||}||}.||.,,{{{{{((((({((.(((((,,({{{{(((((.(({(((((,((((....|||{{,.,.,|.(({{{,.....,.((((.....))))...(((((((((((..((((.((((.,....,.))))))))...)))))})),)))...}}}||{||}}}}}))))}}}}}.,|||||{|||{,,,,((({,{,,.|||.,...,}))}..}}}}},,||||||||,,,|||},,})}}|{{|||,.{{{,||{.|,....|||.{{{{|,.||{|,|,,,|||,.,..},,,,}}}}},....}}.}}}}}}}}})}}}},}|,}))}.,)),.,|||||{}}||||}.||,},.))..)))).,},)))))).))))))},,},,}.,,||}||}}))}..)}..})))}}}}}|||.}}}}}})))},)))))}}}((((((((....))))))))((((((....))))))}))))))}})})}||||(({,,,||,,,}})),)))}...{,{((((((...)))))))}.(((((((((((({(,{((...((((((((((......(((((((.{((.((((.((((((.((((((((((...)))))...))))).)))))).))))...,{({,..........{(..(({{{{|....,}},},}).,)},,,},,.....,,|||{{{{(((((((({...((((.......((((((....(((........)))))))))))))...})).)))))}|||}||{{{{..((((((({{({....)))))))))).{((((((.(((..,....,..))).))))))))))))}..,...))).)))))))..)))))}}))))..))))}..(((...(((((((({,((((.......))))))).)))))))))((((((((((((...((((((.(((..((...)).))).))))))..........))))))).)))))..((((((...))))))....))))))))))))..))))).)))))))))},)))..))))))))))))}}}..(({((,..}}}}}........{((((((((((........)))),.)))))))),),),))))))))))).))..)))))).)))))))))))))))((...(((((...((((....))))((((((....))))))((((({||,...}))})))).)))))))
Forensic Context

No forensic context available.