Basic Information

Symbol
hsa_SHPRH_0011900
RNA Class
circRNA
Alias
hsa_circ_0078146 hsa_circSHPRH_009 hsa-SHPRH_0032
Host gene
SHPRH
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
6:146256043-146256577 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
6:145934907-145935441 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-131.8 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -140.12 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 92.02
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
...(((((((...((((((.............((((((..(.((((...)))).)..))))))((.((((((((((((((...........((..((((((((.((((((((..((........))..))))))))((((........))))(.((((.....)))))...((((((((((....((((((((.(.((...((((((.......)))))).))).)))))).)).((..((((((.....))))))...)).)))))))))).....((((((((((((((.(((((((((((...)))).))))))).))))))..........))).))))).......)))))))).)).(((((.....)))))......))))))...)))))))).))..)))))))))))))..
Thermodynamic Ensemble Prediction
...(((((((,..((((((,......,...,{((((((.{(,((((...)))).)}}))))))||,{(((((({((((({..,|,...,.,|,..(((((((({((((((((..{(.,,.....))..))))))))}|{(,,...||.||||(,((({..,,.}}}}}...((((((((((..,.{,((((((.,.((...((((((.......)))))).})}.)))))).}}.{{,.((((((,...,)))))),}.)).)))))))))).....{{{{{{{,,(((((.(((((((((((...)))).))))))).))))))|.,.,,,,}.))).))})),......}))))))).,,.(((((.,,..)))))......))))))...)))))))).,...)))))))))))))..
Forensic Context

No forensic context available.