Basic Information

Symbol
hsa_chr9_0040000
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-ABCA1_0035
Host gene
ABCA1
Type of circRNA
Intergenic-Intergenic
Location (GRCh37)
9:107586731-107587261 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
9:104824450-104824980 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-160.20 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -169.12 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 123.74
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((...........))((((((((..((((((((((((((.(((.((((((((((((((.(((.((((((((((((.((....))..))))).(((((((((((((..(((.((((((.((((((((((..(((..((..(((...(((....)))..)))..)).)))..))))))).....))).))))))))).)))..))))..)))))).(((((((((((((...........)))))).)))))))(((...((((((.((.(((..(((.(((...((.(((((...)))))))))).)))....))).))))))))......)))..((((..(....)..))))...........))))))).)))))))...)))))).))))..)))...)))))))).)))...)))....((((((...((..((((.((((...........)))).))))...))...))))))..(((((((((.....)))))).)))...((((((...))))))))))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
((.{.......,,))((((((((..{,,(((((((((((.(((.((((((((((((((.(((.((((((((((,,.((,,..||,.}}}||{((((((((({(((..(({{((((((.((((((((((..(((..((..(((...(((....)))..)))..)).)))..))))))).....))).))))))))).)))..})))..)))))).|||,((({{{,|.,,,}},.....|||{||{||,,||(((,...((((({,({.{{{..(((.(({...((.{((((,,.,}))))))}}.)))....})).}}))))))......}}}}}||(({.,..))).,}}))}}|}..,,,.)))))))).)))))))...)))))).))))..))).,,)))))))).)))...,,,....((((((...{{..((((.((((...........)))).))))...)}...)))))).,(((((((((.....)))))).)))...((((((...))))))))))))))
Forensic Context

No forensic context available.