Basic Information

Symbol
hsa_FGD4_0006800
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0000389 hsa_circFGD4_008
Host gene
FGD4
Type of circRNA
Intron-Exon-Intron
Location (GRCh37)
12:32749558-32764217 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
12:32596624-32611283 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-723.90 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -776.05 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 655.89
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
........(((((((((.((((((.....(((((((.((((.((((((((((((((.((.((((((..(((.((((..((((.(((.(((((((.(((((((((..........))))))).........(((((.......))))).................((((((.(((.((((((((((.(((((.(((((((((((.(((((.(.((((..(((................(((((..(((((((..((((((((.(((..(((((((((((((.((((((((..(((.((((((.(((((((((((((((((............(((((((((.((((((((......)))).)))).)))))))))(((((.(((((.(((((..................((((((...(((.((((((..((((....(((((..((((..((((..((((.((((((..(((.((((((((........)))))))).))).)))))).))))))))...)))).)))))...(.((((((........)))))).).(((..((((.(((.((((((.....(((........)))......)))))).((((((...)))))).((((((((((.((((((..(((.(((....((((..((((...((((((.(.((((..(((...(((((((.(((((......)))))))))........)))...)))..)))).))))))).............))))..))))...))))))..)))))).............((....))...........))))))))))...)))))))..))).....(((((.......)))))))))))))))..)))...(((((((((..(((((((((....))).)).)))).)))))))))((((..(((.((((((.(((....((((((((..((((((((((((....)))))))))..)))..))......))))))..))))))))))))..)))).((((((((.........))))))))((((.(((((.........))))).))))....................)))))).............(((((.(((((....(((((((..((((........((((((((((((.....)))))).))))))...((((((((.....)).)))))))))).)))))))....)))))..)))))...)))))..))))))))))))))))))))))))))).)))))))))..)))))))).)))))))))))))..))).)))))))).)))))))..))))))))..)))).).))))).))))))))))).))))).)))))))))).))).))).))))).))))))).))).))))..)))).)))..)))))).)).)))))))))))))).)))).)))))))........((((((((....))))))))......))))))...........(((((((...)))))))((....)).((((((...................))))))......................................)))))))))(((((((((...((.((((((...))))))))((.((((((((((((((...((((..((...(((.....)))...))..))))..)))..)))))..)))))).))(((((...((((((....(((((((.((....((.(((((....(((((((.......((((((((((..(((((.((..((((....(((((.((((..(((((((....(((((((.(((.(((((((((((((.(((((.....(((((((((..((((............)))).)))))))))(((((((((.(((.(((....))).))).)))))...))))(((......)))...((((((((((.(((........)))..))))))))))...(((((((..................))))))).........((((((.....((((((((.((....)).))))....))))......)))))).....))))))))))))))).........))).))).))).))))....))))))).)))).)))))...)))).....)).)))))...(((((..(((.............)))..)))))((((((((((((((.(((((((....))))...(((((...)))))....((........)).(((((.((((((.(((.((((...)))).)))...)))))).)))))((((((.(......)))))))....)))..))))))...))))))))..((((........))))............(((.(((((........((((((.(((......(((...........)))......))).))))))..........)))))..)))....................))))))))))............)))))))...))))).)))).))))))).....)))))).)))))...)))))))))....
Thermodynamic Ensemble Prediction
........(((((((((.,{{{,(,,,..(((((((.((((.((((((((((((((.{{.((((((..(((.((((..((((.(((.(((((((.(((((((((..........)))))))..,......(((((.......))))){{{{{..........})}||,((,(((.((((((((((.(((((.(((((((((((.(((((.,.((((,,(({{...,....}.....{(((((..(((((((..((((((((.(((..(((((((((((((.((((((((..((,{((((((.(((((((((((({{,.....,{{(((.((((((((({,..{((((((((((({{...}}}})})}))))))},,,.|,.(((((((((............},}})))))|,,,...,,,.((((({..{(((({...{{{{..{{(({,{{({.,{(((,{({(({{(((({,,,,{((({{{{,,,,||,|{(({{(((((|||...{{|....))}.,}},))))))}}}}}|{{{{{...,,...}||}},...,,,,.|||{.,...((((((.....(((........)))......})))))..,(((((((.(((((....))))).)))))))|(((({.,,,....||||},||||,,.((((((.(.((((..(((...(({(((,,(((((......)))))))))........)))...)))..)))).}))))))......,,..,..}}}}..})),...}}},.}}})))}}},,}},.,||,||{{{....,,......,,.....,},,},}}..}})}},}}},)))}.,,...|||}..}})},,,))))))))))))..}}}...(((((((((..(((,(((((....))).)),)),,.))))))))){{((..(((.((((((.(((....((((((((..((((((((((((....)))))))))..)))..),.....,))))))..))))))))})))..}})).{(((((((.........)))))))},|||.{,{((,{,,,,,..}}})),))}},,,,.|{||..........})))},.,,,,{.{,,,,{.{,{({{({(((,{,.(((((((..{{{(....,,..((((((((((((.....)))))).))))))..,|{|{|||,.,,..},,))}}},}))),))))))),}),))))).}))))),})),,.,,)))))))).))))))))))))))))))).)))))))))..)))))))).)))))))))))))..))).)))))))).)))))))..))))))}}..)))),),))))).))))))))))).))))).}))))))))).)))}),}.,}))).))))))).))).))))..)))).)))..)))))).}}.)))))))))))))).)))).)))))))........((((((((....))))))))......||||,|....,......(((((({...}))))))||..,.}},||||||....,{,.{,,........|},,,..................}}}}}.,||......,.,,..)))))))))(((((((((...,,.{{((((,..}}))))),({.(((((({{((((({.{.{({{.,{{,..(((.....)))...})..)))}.,)),..)))))..)))))).)){((((...((((((.,..(((((((.((,...{(.(((((....(((((((..,,...((((((((((.,|||{||||{{((({.{{.,,,,,.||,|}}}||,,(({{{{((,,((,{((,.,,,|||||,,,.|||||||,....(((((((((..((((............)))).)))))))))(((((((((.(((.(((....))).))).)))))...)))){{(,{{,{{|||...((((((((((.(((........)))..))))))))))...,{{|{||,,,..{{{{{{{{{{{{{|||||,|{|..,||,,{{{{{{.,,...,{,,{,,{(({{...{(({{{....,..|.{{{...{||||.....,))))),,,))),),.....}}}})),.,})})))|{||{{{{{|,,}||{{|,}|,|||}|,{..,||{{{{{{,...{{{,,,((({{,,(((.......,,,,..,,},.}}}}}((((((((((((((.(((((((....))))...(((({...}))))....((........)),(((((.((((((.(((.((((...)))).)))...)))))).)))))|(((({,(,....,))))))}....}))..))))))...))))))))..{({(,,......}))}.,,....,,...||,...|||.}}.,,,}}|||,,.|}}}}}.}}|))},.,,}},,..,||,,,{,..,)}))))}},}}.}))}}})))))))))}}},..,,,,},}}}}....,))))))))))..........,,))))))).,.))))).)))).))))))).....)))))).))))}...))))))))),...
Forensic Context

No forensic context available.