Basic Information

Symbol
hsa_FGD4_0007100
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0025844 hsa_circFGD4_014 hsa-FGD4_0061
Host gene
FGD4
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
12:32751431-32777386 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
12:32598497-32624452 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-214.90 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -233.07 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 212.12
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(.......(((((((((..((((............)))).)))))))))(((((((((.(((.(((....))).))).)))))...))))(((......)))...((((((((((.(((........)))..))))))))))...(((((((..................))))))).......)(((((((......((..(((((((((((((((.........((((....(((((......)))))....(((((.....)))))....((((((.((((((...........((.((((((((.....(((((.((......)).))))).((((......))))...)))))))).))((((((((((((.(((((((....))))...(((((...)))))....((........)).(((((.((((((.(((.((((...)))).)))...)))))).)))))((((((.(......)))))))....)))..))))))...)))))))))))).)))))).....................(((((((((.......(((((.(((......(((...........)))......))).)))))..........((((((...(((.(((((((..........(((((................)))))..............((((((((.(((....))))))).......))))..))))))).)))..))))))))))))))).((((((......((((..((((....(((((..((((((((.(.(((....))).).)))).))))..........)))))..))))..)))).......))))))..((((((((.(((.......)))..)).)))))).))))..))))))))).))))))..)).....)))))...))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(.......(((((((((..((((............)))).)))))))))(((((((((.(((.(((....))).))).)))))...))))(((......}))...((((((((((.(((........)))..))))))))))...(((((((..................))))))).......)({(((((..,...((..(((((((((((((((.........((((....(((((......))))}....{|{{|...,})}}}|,...{(((((,(({(((,....,,,,,{{{.{{||||{|..,,|||{{({,,.,,.,,,.,{{||}.{{{|......,..,...))}}))))}|{((((((((((((.(((((((....))))...(((((...)))))....((........)),(((((.((((((.(((.((((...)))).)))...)))))).)))))|(((({,(,....,))))))}....)))..))))))...)))))))),}||,|}}}},...,}}....,..........(((((((((,..,,,(((({{.({{......{{{.....,,....}}}......}}).))))),.........,(((((,{{{(({(((({(...,,,,....{{(((................}}}||,....,,,,,....{{((((((.(({....))))))).......)))}..))))))).))),,))})})))))))))).{|{|||......{{((.,((({,.,,{{(({..{{{,,||{{{.{,|||,,,}},),|})}.,,}},)}...,,|.})}}}.,}}}}..}))}......,))))}}..((((((,{,(((.........),,,}.)))))}.})))..))))))))).))))))..}}..,..)))))...))
Forensic Context

No forensic context available.