Basic Information
Symbol
hsa_FGD4_0008100
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0098417
hsa_circFGD4_015
hsa-FGD4_0021
Host gene
FGD4
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
12:32751431-32778713
UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
12:32598497-32625779
UCSC (hg38)
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-297.20 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-320.86 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
343.64
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((.((..(((((((((..((((............)))).)))))))))(((((((((.(((.(((....))).))).)))))...))))....((..(((((((((((.(((((((((((...(((((((((.((....((((((.......))))))))))....(((((.((((((.(........).)))))).)))))..((((((((((.(((........)))..)))))))))))))))))...)))....))))))))...))))))...........)))))..)).(((((((.((((((..((((.....(((((....((((.(((..(((((.((.((((((((....)))..........(((((((.(((((...((((((.....))))))..))))).(((......))).(((((..(((.............)))..)))))((((((((((((((.(((((((....))))...(((((...)))))....((........)).(((((.((((((.(((.((((...)))).)))...)))))).)))))((((((.(......)))))))....)))..))))))...))))))))..((((........))))..............(((((((((.......(((((.(((......(((...........)))......))).)))))..........((((((...(((.(((((((..........(((((................)))))..............((((((((.(((....))))))).......))))..))))))).)))..))))))))))))))).)).)))))..)))))))...)))))..)))..))))...)))))..))))..))))))..)).)))))...........)).)))(..........(((((((((...((((((((.(((.......)))..)).))))))..(((((.....)))))((..(((((....(((((..(((....((((...(((....((.((((((((....))))))))))....))).....(((....)))))))....)))))))).(((((.(((....))).)))))...(((........)))..((((..(((...........(((.((..((((((((((.((.....)).)))).)))))))).)))...)))..)))).)))))..))))))))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
{{{.{,..(((((((((..((((............)))).)))))))))(((((((((.(((.(((....))).))).)))))...))))....,,..{((({((((((.(((((((((({...(((((((((.{{....((((((.......))))))}}})..,,({{{{.{{{|||,(,,..,,,,}.}})))),)))),..((((((((((.(((........)))..)))))))))))))))))...}}}....))))))))...)))}}}.......|||||||||..|,.{(({{((.((((((..((((.....{{{{(.,,.{{{(,(((..{{{{|}||,,,,|{((|,.,.,,}}}|||...{{((((,(({(((,,...{{{{{{||.,{||||||..,}}}|,{{{,,..,.,,,.{{{||,.{{{,......,..,..,))},))))}((((((((((((((.(((((((....))))...(((((...)))))....((........)),(((((.((((((.(((.((((...)))).)))...)))))).)))))|(((({,(,....,))))))}....)))..))))))...)))))))),|||{|}},,....,}},..,...........(((((((((,..,,,(((({{.({{......{{{.....,,....}}}......}}).))))),.........,(((((,{{{((((((({(...,,,,....{{(((................)}}||,....,,,,,....{{((((((.(({....))))))).......)))}..))))))).))),,))})})))))))))).,}}))},},,,,}}||,,,,||}}},,|||..}|||..,}|}|}..}}}}..})))}},,}}.}))})......,,|.||,.}||,.........,{{{{{|||{..,((((((,{.(((........,},,,}.))))}}.,({{{,.,,,,))))}|{..{{{{{.,..{,|,{|.....,.}|||||..,...|||{{.{(((((({....})))))))||,.{{||,.....(((....)}}..||.,..,,.,}})}.(((((.{{{....})).)))))...(((........)))..||||}.|{{...........(((.({..((((((((((.((.....)).))))}})))))}).))),,,))},,)})).})))).,)}}}))})))))
Forensic Context
No forensic context available.