Basic Information

Symbol
hsa_FGD4_0007200
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0025845 hsa_circFGD4_017
Host gene
FGD4
Type of circRNA
Intron-Exon-Intron
Location (GRCh37)
12:32751431-32791863 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
12:32598497-32638929 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-400.70 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -429.68 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 335.51
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((((..(((((((((..((((............)))).)))))))))(((((((((.(((.(((....))).))).)))))...))))(((......)))...((((((((((.(((........)))..))))))))))...(((((((..................)))))))......(((((((((.((...(((((((((((....((((((.......(.(((...(((((......)))))...))).)......)))))).....(((((((.(((((...((((((.....))))))..))))).(((......))).(((((..(((.............)))..)))))((((((((((((((.(((((((....))))...(((((...)))))....((........)).(((((.((((((.(((.((((...)))).)))...)))))).)))))((((((.(......)))))))....)))..))))))...))))))))..((((........))))........(((((.(((((((.((((...((((((((.....(((((......((((............))))......)))))....))))))))......((.((..((((....(((((................))))))))).)).)).....((((((.((..(((((..(((........))).(((((((((.(((.........(((((((.(((((...(((.(((((.(((((..((((((...(((..(((((......(((..(((((((((((.........(((.((...((........))...)).)))....((((((((.(((.......)))..)).)))))).((((((.....))))))............(((.((........)))))......))))))))))).)))......((((.((((((((.((.((((..(((((....).))))..))))..))..))))))))...)))))))))..)))..))))))))))).))))).............(((.((..((((((((((.((.....)).)))).)))))))).)))........((((((..(((((..((.((...(((((((....(((.....))))))))))...)))).)))))..))))))(((((...((((....(((((....)))))....)))))))))...)))...))))))))))))......))))))))))))..(((((((.(((...........))).)))))))..)))))..)).))))))(((((((.....)))))))(((((....))))).....((((((.(......).))))))........))))))))))).)))))))))))).(((((((......))).(((((((((....)))))))))....)))))))))))))))))..)))))..(((((.......))))).((((....)))))))))))))).....(((((((...........)))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
((({({..(((((((((..((((............)))).))))))))}(((((((((.(((.(((....))).))).)))))...))))(((......}))...((((((((((.(((........)))..))))))))))...(((((((..................))))))).....,(({{(((((.{(...(((((((((((....((((((.......(.(((...(((((......)))))...))).)......)))))).....((((((({(((({...((((((.....}}}}|}..}}}}},{{{......|,,.({{{{,.(((,......,..,..,}),.))))}((((((((((((((.(((((((....))))...(((((...)))))....((........)),(((((.((((((.(((.((((...)))).)))...)))))).)))))|(((({,(,....,))))))}....)))..))))))...))))))))..((((........))))........,{{{(.({(((((,({((.,.{((({{{(,,.,..{{{(|.....||,,..,|,.......))})}}},..}}}}},...}|}}}}}},.....,,.,...,,,,....{||||................|}|||{....))))}.....{(((((.{{..(((({.,(((........))}.(((((((((.(((.........(((((((.(((((.,.(((.{((((.(((((..((((((...(((.,(((((,.....,{{..(((((((((((.........{((.({...((.....,..}}...}}.}}}....((((((,{.(((.......,,),,,},)))))}.{({{({.,.,,}))}},.........,.,(,,.({.......})})))......))))))))))).,,,......{(((.((((((((..(,{((({.{({||....}.}}}),.))))..,},.))))))))...))))))))).,}))..))))))))))).))))},,...........(((.({..((((((((((.((.....)).))))}}))))))).)))...,,...((((((..(((((..{{.{{...((((({,.,,{(((.....))))))))))...)|}}.)))))..)))))){((((...((((....(((((....)))))....)))))))))...))).,.))))))))))))......))))))))))))..,{{,,{{.,{{...,,..{{|{..,.))))},...)))))..)}.)))))}(((((((.....)))))))(((((....))))).....((((((.(......).)))))).......,))))))))))).}))))))))))),(((((({......,,,.(((((((((....)))))))))..},)))))))))))))))}}..)))))..||(((,,,....||}}}.||,{..}}))))}}))})}}}}.||,|{((({{,....},,....}}}))))
Forensic Context

No forensic context available.