Basic Information

Symbol
hsa_FGD4_0009800
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0098422 hsa_circFGD4_021 hsa-FGD4_0042
Host gene
FGD4
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
12:32755095-32778713 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
12:32602161-32625779 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-209.50 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -229.34 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 209.06
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((..(((((.((.((((((((....)))..........(((((((.(((((...((((((.....))))))..))))).(((......))).(((((..(((.............)))..)))))((((((((((((((.(((((((....))))...(((((...)))))....((........)).(((((.((((((.(((.((((...)))).)))...)))))).)))))((((((.(......)))))))....)))..))))))...))))))))..((((........))))..............(((((((((.......(((((.(((......(((...........)))......))).)))))..........((((((...(((.(((((((..........(((((................)))))..............((((((((.(((....))))))).......))))..))))))).)))..))))))))))))))).)).)))))..)))))))...)))))..)))(.(((((((((((((...(((((((((((((((((.........(((.((...((........))...)).)))....((((((((.(((.......)))..)).)))))).((((((.....))))))............(((.((........)))))......)))))))))))..(((((....).))))))))))......(((....)))..((((......)))).(((((.(((....))).)))))...(((........)))..((((..(((...........(((.((..((((((((((.((.....)).)))).)))))))).)))...)))..))))....)))))).))))))).)
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((..(((((.((.(((((((,.{{{{.}|||,,...{(((((,(({(((,,...,,{,{{||.,{||||||..,}}}|,{{{,,....,,,.{{{||,.{{{,......,..,...))},))))}|(((((((((((((.(((((((....))))...(((((...)))))....((........)),(((((.((((((.(((.((((...)))).)))...)))))).)))))|(((({,(,....,))))))}....)))..))))))...)))))))),,||{|,,,,,...}}},...,..........(((((((((,...,,(((({{.({{......{{{.....,,....}}}......}}).))))),.........,(((((,{{{((((((({(...,,,,....{{(((................)}}||,....,,,,,....{{((((((.(({....))))))).......)))}..))))))).))),,))})})))))))))).,)})),,))})})))))...)))))..)))(.(((((((((((((....((({{(((((((((((.........{((.((...((........)}...)).})}....((((((,{.(((.......,,),,,},)))))}.{({{({.,.,,}))}},.........,.,(,,.({.......})})))......))))))))))),{((,{,...,|,|}||||{{|{..,.,,(((..,,}},..,|,|..,..,)))}.{{{{|,|||,,,.}}),))}}}...{{|.....,,}))|,,((((..(((...........(((.((..((((((((((.((.....)).))))}}))))))).)))...)))..)))).,}})))))).))))))).)
Forensic Context

No forensic context available.