Basic Information

Symbol
hsa_ABCA1_0007900
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-ABCA1_0146
Host gene
ABCA1
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
9:107586746-107589340 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
9:104824465-104827059 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-142.50 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -152.22 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 162.84
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.((((...)))).(((((..((((((..........)))))))))))...((((.((((.....)))).)))).((((((.(((.(((((..((........))..)))))))))))))).((((..(((((((((((((((((..((..(((((((((((((...)))).))))(((.((((((.(((((......(((.(((......(((((((((((((((((((.(((.....(((.....))).....))).))))).......))))))))))))))....)))..)))........)))))..))))))))))))))...))..))))))))...((((((((((((..((((.((....)))))))))))))))))).....))))))))).(((((....)))))..))))..........
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((((....(((((((({{{(((((({..........{{((((..((.(((((((((((,,....,})}))...))))))))..)))))}..,,........)}})))))).}),)))))))).....)))))((({((({({((({(,.{{{({{((((((,{{....)}).))))))..,}}})))}}}{||||..,{{.....}}.}||||,|{{|||{{({(((((({{{(,{,({((,,((({{((({(((,,(,{({....||,|.,|....}})))),,.})),.})))},))})))))))}}}}}||{((((,{,,.{{....,}},)))}||||{{{{((((((({.{(({{.{{.,,,)))))))))))))))))}.),)),.}))))),,{((((....)))))..{,.....})..)))
Forensic Context

No forensic context available.