Basic Information

Symbol
hsa_FGD4_0006700
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-FGD4_0090
Host gene
FGD4
Type of circRNA
Intron-Exon-Intron
Location (GRCh37)
12:32749538-32772804 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
12:32596604-32619870 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-775.20 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -830.27 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 754.35
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
..(((((((((.((((..(((.(......((((((((..(((((((((((((((((.((((.((((((((((((((.((.((((((..(((.((((..((((.(((.(((((((.(((((((((..........))))))).........(((((.......))))).................((((((.(((.((((((((((.(((((.(((((((((((.(((((.(.((((..(((................(((((..(((((((..((((((((.(((..(((((((((((((.((((((((..(((.((((((.(((((((((((((((((............(((((((((.((((((((......)))).)))).)))))))))(((((.(((((.(((((..................((((((...(((.((((((..((((....(((((..((((..((((..((((.((((((..(((.((((((((........)))))))).))).)))))).))))))))...)))).)))))...(.((((((........)))))).).(((..((((.(((.((((((.....(((........)))......)))))).((((((...)))))).((((((((((.((((((..(((.(((....((((..((((...((((((.(.((((..(((...(((((((.(((((......)))))))))........)))...)))..)))).))))))).............))))..))))...))))))..)))))).............((....))...........))))))))))...)))))))..))).....(((((.......)))))))))))))))..)))...(((((((((..(((((((((....))).)).)))).)))))))))((((..(((.((((((.(((....((((((((..((((((((((((....)))))))))..)))..))......))))))..))))))))))))..)))).((((((((.........))))))))((((.(((((.........))))).))))....................)))))).............(((((.(((((....(((((((..((((........((((((((((((.....)))))).))))))...((((((((.....)).)))))))))).)))))))....)))))..)))))...)))))..))))))))))))))))))))))))))).)))))))))..)))))))).)))))))))))))..))).)))))))).)))))))..))))))))..)))).).))))).))))))))))).))))).)))))))))).))).))).))))).))))))).))).))))..)))).)))..)))))).)).)))))))))))))).)))).))))))(((((((((((((((((....))))))......((((((.((..(((......((((((...)))))))))..))))))))......(((..((((((((...((((((......((((((((..(((.(((..((((....((((.(((((..((....(((((.(((.......))).))))).......))...)))))..))))..))))..))))))..((((...((((((((....((((.((((.(((....((((....)))))))))))))))(((((.........)))))(((((((.(((((..(((((...))))).))))))))))))...))))))))......)))).))))))))...((((....)))).)))))).))))))))..)))..(((((((((..((((............)))).)))))))))(((((((((.(((.(((....))).))).)))))...)))))))))))))))....((((((((((.(((........)))..))))))))))...(((((((..................))))))).......)))))))).))).(((((((.((((((..((((.....(((((....((((.(((..(((((.((.((((((((....)))..........(((((((.(((((...((((((.....))))))..))))).(((......))).(((((..(((.............)))..)))))((((((((((((((.(((((((....))))...(((((...)))))....((........)).(((((.((((((.(((.((((...)))).)))...)))))).)))))((((((.(......)))))))....)))..))))))...))))))))..((((........))))..............(((((((((.......(((((.(((......(((...........)))......))).)))))..........((((((...(((.(((((((..........(((((................)))))..............((((((((.(((....))))))).......))))..))))))).)))..))))))))))))))).)).)))))..)))))))...)))))..)))..))))...)))))..))))..))))))..)).)))))......(((.((...((........))...)).)))...))))))))).))))))))))))))))..((((.........))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
..(((((((((((({...{{(,{......((((((({{(((..((((..(((((((.((((.((((((((((((((.{{.((((((..(((.((((..((((.(((.(((((((.(((((((((..........)))))))..,......(((((.......))))){{{{{..........})}||,((,(((.((((((((((.(((((.(((((((((((.(((((.,.((((,,(({{...,....}.....{(((((..(((((((..((((((((.(((..(((((((((((((.((((((((..((,{((((((.(((((((((((({{,.....,{{(((.((((((((({,..{((((((((((({{...}}}})})}))))))},,,.|,.(((((((((............},}})))))|,,,...,,,.((((({..{(((({...{{{{..{{(({,{{({.,{(((,{({(({{(((({,,,,{((({{{{,,,,||,|{(({{(((((|||...{{|....))}.,}},))))))}}}}}|{{{{{...,,...}||}},...,,,,.|||{.,...((((((.....(((........)))......})))))..,(((((((.(((((....))))).)))))))|(((({.,,,....||||},||||,,.((((((.(.((((..(((...(({(((,,(((((......)))))))))........)))...)))..)))).}))))))......,,..,..}}}}..})),...}}},.}}})))}}},,}},.,||,||{{{....,,......,,.....,},,},}}..}})}},}}},)))}.,,...|||}..}})},,,))))))))))))..}}}...(((((((((..(((,(((((....))).)),)),,.))))))))){{((..(((.((((((.(((....((((((((..((((((((((((....)))))))))..)))..),.....,))))))..))))))))})))..}})).{(((((((.........)))))))},|||.{,{((,{,,,,,..}}})),))}},,,,.|{||..........})))},.,,,,{.{,,,,{.{,{({{({(((,{,.(((((((..{{{(....,,..((((((((((((.....)))))).))))))..,|{|{|||,.,,..},,))}}},}))),))))))),}),))))).}))))),})),,.,,)))))))).))))))))))))))))))).)))))))))..)))))))).)))))))))))))..))).)))))))).)))))))..))))))}}..)))),),))))).))))))))))).))))).}))))))))).)))}),}.,}))).))))))).))).))))..)))).)))..)))))).}}.)))))))))))))).)))).))))))).......,((((((((....}))))}}}.....,,|{{.,...{{,.....{((((({...}))))))||..,,}}||{((((..{{{(,((({,.,...,.{{({{,..({{(...(({...{((((((,.{((((...,{,,,.,,||,{{(({,,{(((((...,,.,,(({{,..}})))}},{,.{{{{{{||||{{{|,|,,{||,,,,|,.{{{.....)))..,}),,}})},}})},.})))},,|}}}}},||{{{{|.|,((((((.,..(((((((.((,...{(.(((((,,,.(((((((..,,,..{(((((((({,,||||||||{{{{{{.{{.,,,,,.||,|}}}||,,(({{{{((,,((,{((,.,,,|||||,,,,|}|||||,....(((((((((..((((............)))).)))))))))(((((((((.(((.(((....))).))).)))))...)))){{(,{{,{{|||...((((((((((.(((........)))..))))))))))...,{{|{||,,,..{{{{{{{{{{{{{|||||,|,|..,,||,{{{{{{.,,...,{{{{,,{(({{...{(({{{....,..{.{{{...{||||.....,))))),,,))),),.....}}}})),.,})})))|{||{{{{{|,,}||{{|}}|,|||}|{{..,||{{{{{{,...{{{,,,((({{,,(((.......,,,,..,}},.})))}((((((((((((((.(((((((....))))...(((({...}))))....((........)),(((((.((((((.(((.((((...)))).)))...)))))).)))))|(((({,(,....,))))))}....}))..))))))...))))))))..{({(,,......}))}.,,.....,...|||.,,|||,}}.,,,}||||,,.|||,}}.},||}},..,}},,..,||,,,{,..})}))))}},}}.}))}}})))))}})}}}},..,,,,},}}}}....,)))))))))}..........},))))))).,.))))}.)))).))))))).....)))))).}}}}}...)))})))))))}...(((({...}))))..||{(,,,|}}}.....}})}}}}})))).,.)}}...)))),,}))),},}}})}}}}}}},}}..})))}},....,|,,.....,||,....,.......))))..))))))))))),.))))))))))))))))..((((.........))))
Forensic Context

No forensic context available.