Basic Information

Symbol
hsa_FGD4_0008800
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-FGD4_0133
Host gene
FGD4
Type of circRNA
Intron-Exon
Location (GRCh37)
12:32753344-32793387 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
12:32600410-32640453 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-525.70 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -559.99 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 369.36
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(...((((.(((.((((((.(((((((((((...(((((((((.((....((((((.......))))))))))....(((((.((((((.(........).)))))).)))))..((((((((((.(((........)))..)))))))))))))))))...)))....))))))))...))))))...........(((((......((..(((((((((((((((.........((((....(((((......)))))....(((((.....)))))....((((((.((((((...........((.((((((((.....(((((.((......)).))))).((((......))))...)))))))).))((((((((((((.(((((((....))))...(((((...)))))....((........)).(((((.((((((.(((.((((...)))).)))...)))))).)))))((((((.(......)))))))....)))..))))))...)))))))))))).)))))).....................(((((((((.......(((((.(((......(((...........)))......))).)))))..........((((((...(((.(((((((..........(((((................)))))..............((((((((.(((....))))))).......))))..))))))).)))..))))))))))))))).((((((......((((..((((....(((((..((((((((.(.(((....))).).)))).))))..........)))))..))))..)))).......))))))..((((((((.(((.......)))..)).)))))).))))..))))))))).))))))..)).....)))))(((.(((.(((((((..(((.((.....))))).)))))))..))).)))((((..(((((.(((((((((.(...(((((......)))))...)))))(((((......(((((.((((((((....))))))))....((((......(((....))))))).............(((((.(((....))).)))))...(((........)))..)))))...............(((.((..((((((((((.((.....)).)))).)))))))).)))))))))))))..))))).)))).(((((...(.((((((.((((.....((((.((((((.((((((....(((...(((((((((...((((....(((((....)))))....))))............(((((.....)))))...............((((((....))))))((.(((((((((.(((.........((((((...((((((.((((((.((..(((((((.(((.((((((...((........))((((((.(((((......)).))).))))))......))))))..((((.(((..........))).))))....((((((((......)))))))).(((((.(((.((((.(((...)))...))..)).))).)))))....))).)))))))..))(((((((.....)))))))(((((....))))).....((((((.(......).)))))).....)))))).))))))...))))))..))))))))....))))..))....)))))))))....))))))))).))))))))).).....)))).)))).)).)....)))))(((((...)))))..))).))))..)(.(((.((((((...((((...((((.....))))..))))..((((((...))))))......))))))))).)
Thermodynamic Ensemble Prediction
(...((((.(((.((((((.(((((((((({...(((((((((.({....((((((.......))))))})))..,,({{{{.{{{|||,(,,..,,,,}.}})))),)))),..((((((((((.(((........)))..)))))))))))))))))...}))....))))))))...))))))...........(((((..,...((..(((((((((((((((.........({((....(((((......})))}...,{|{||...,})}}}|,...{(((((,(({(((,....,,,,,{{{.{{||||{|..,,|||{{({,,.,,.,,,.{{{||}.{{{,......,..,...))}}))))}|{((((((((((((.(((((((....))))...(((((...)))))....((........)),(((((.((((((.(((.((((...)))).)))...)))))).)))))|(((({,(,....,))))))}....)))..))))))...)))))))),}||,|}}},,...,}},...,..........(((((((((,..,,,(((({{.({{......{{{.....,,....}}}......}}),))))),.........,(((((,{{{(({(((({(...,,,,....{{(((................}}}||,....,,,},....{{((((((.(({....))))))).......)))}.,))))))).))),,))})})))))))))).||{|||.,....{{{(.,((({,.{,{{(({.,{{{,,||{{|,,,|||,,,}},),}}}}.,,}}})}...,,|,}}}}}.,|}}}..}}}}.....,,})))},..((((((,{,(((.........),,,}.)))))}.})))..))))))))).))))))..}}..,..)))))(((.(((.(((((((..(((.{(.....}}))).)))))))..))).)))((((..(((((.((((({(((,(,,,(((((......)))))...}})))(((((......(((((.((((((((....}))))))),,,.{{{|,.....(((....))}.,||,,..,...,})}.(((((.(((....))).)))))...(((........)))..))))).|,............(((.{,..((((((((((.((.....)).))))}})))))}).)))))))))))))..))))).)))).(((((...(,((((((.((((.....{(((.{(((((.((((((....(((...(((((((((...((((....(((((....)))))....)))}.,,.....,,,.{((((.....))))}...............((((({....}))))){{,((,((((((.(((.,.......{(((((...((((((.((((((,((..(((((((.(((.((((((,..((....,,..))((((((.(((((......)).))).))))))......)))))},.((((.(((..........))).)))).,..((((((((......)))))))).(((((.(((.(({{.{{,...,},.,.}}..)).))).)))))....))).)))))))..))|((((((.....)))))),(((((....))))).....((((((.(......).)))))).....)))))).))))))...))))))}.)))))))))..,})},..)}.,..)))))))))....))))))))).))))))))).}.....)))).)))),)).,....)))))(((({...}))))..))).))))..)(.(((.((((((..,((((...((((.....))))..))))..{{((((...}))))}.,,,..))))))))).)
Forensic Context

No forensic context available.