Basic Information

Symbol
hsa_TULP4_0006500
RNA Class
circRNA
Alias
hsa_circ_0001660 hsa_circTULP4_013 hsa-TULP4_0015
Host gene
TULP4
Type of circRNA
Intron-Exon-Intron
Location (GRCh37)
6:158850768-158852695 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
6:158429736-158431663 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-565.9 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -604.49 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 410.9
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
..((((..((((((((.((((((((..((((.............))))....(((((((((((.(((.((((((.((((((((((........)))))).))...))..)))))).))).........((((.(((((.(((((...((((........))))...(((((((((.((.(((.(((((.((((.....(((((..((((.((.((.((((((..(((((.((((((.(((((((((.((....)).(((((.........((((((((.....((((...((((((.(((...................((.((((.((((((....(((((.......)))))......))))))..)))).))..(((((((((......)))))))))......((((((....))))))((((((....))))))((((..((((.((((((.....))))))))))..)))).....))).))))))...(((((...((((.....((((......)))).....))))....)))))((....))......(((((((((((((((.(((....((((((((....))))))))((((((((...))))))))...........((((........))))......((((((....(.((((((.(((((......(((((...............)))))......))).)).)))))).)))))))(((((((((.((((....((((((....))))))((((((((((((.(..(((((...(((((((.............))))))).....)))))..)))))))))))))......................(((((((.(.(((((.((....))..))))).))))))))))))(((((..((((.(((((((..(((.((.(.(((((..(((((((.((((....)).)))))))))))))).))).)))....))))))).)))).)))))(((((((((.((((((........((((((((((..........))))))))))........)))))).((((((......)))))).....((..((((.(((......))).))))..)).((((.(((((.....)))))..))))...((((....))))..))))))))))))))))))..........))).))))))))))))))).......)))).....))))))))..........))))).((((((((((((...(((((.(((....))).))))).....)))))))))))))))))))).).))))))))))).))))))))..)).))))..........((((((((((((((....))))).)))))).)))..........(((((((......)))))))))))))))))))))))).)).))))))))).(((.(((((.(((.((((....)))))))((((((......).)))))....((((........))))...((.((((((....((((........)))).....))))))))......((((..((((((((.(((.......(((((....))))).....))))))))))).))))(((.....)))))))).)))))))).))))).)))))))))))))))...(((((((.((..((((((((..(((((((((((.((...((((.(.......).)))))).))))))..))))))).)))))).)).)))).)))(((((...(((((...))))).....(((.((((((((((((......)))))))).))))..)))))))))))))))).)).....))))))....))))((((((...((((((.........)).))))...))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((((((....))).,(((.(((,...(((...(((,{{((((((((.....)))))))))})))))....))).))),{(((((........)))))}))))((.{..((.((((((..(((((..{(((.((((((.,..((...))..,.}.)),,)).)))}(((((((((.((.(((.(((((.((({....,(((((.,((((.((.((.((((((.,(((((.((((({.{((((((((.((....)),({({{..,......(((((((,...,{(.{{,..((((((.(((....,,,,,,,,......,,,.((((.((((((...{(({((.......}))}).,....))))))..)))).}}|.{{{(((((|.,....||||}|}}}...,,.||||||,...,},,,,((((((....)))))){((({{({{{,||||||.,,,,||}}}}}},),})))......))).))))))...(((((...((((.....((((......)))).....))))....)))))||..,,||,.....(((((((((((((((.(((....({{{{{{..,,,|||}}}}}((((((((...)))))))).....,},|,,(({{........}}}}......((((((...,(.((((((.{{{{{..,...{{{{{...............}})}}||....})),},.)))))).}))))))(((((((((.((((....((((({....})))))((((((((((((.(..(((((...(((((((.............))))))).....)))))..)))))))))))))......................(((((((.,.(((((.{(....))..))))).})))))))))))(((((..((((.(((((((..(((.((.(.(((((..{((((((.((((....)).)))))))))))))).))).)))....))))))).)))).))))){{{{{((((,({{{{{........((((((((((..........)))))))))},,{{,,..||}|||.((((((......})))}},,,.{||..{{{,|{{{|,,...|}}|}},}..,..,|||.||||{.....))))},,},}},..||||,,..,,,,..))))))))))))))))))....,,....))).))))))))))))))).,,,,,...}}},.}})))))))).......,..},}}}.((((((((((((...(((((.(((....))).))))).....)))))))))))),))))))).}.))))))))))}.))))))))..}).))))..........{{((((((((((((....))))),))))))},})....,,,,,.,,|||||......,}}})))))))))))))))))))).)).))))))))).(((((.....)))))..((((...))))((.(.(((((((((....(({{{(((((.,....(((((.((((((....((((((((...((((((((((((,,,...,..,,....||,{|{...(((((({{{(((.......(((((....))))).....))))))))))).||||.((({.....)}}}.}}},...(((((((.,......))))))}....,{{|||||||,|,,|{|,{|{.,|||,(,{(({{{.{{..,|||{,|....,,,},))}})),))))))},.))))))))...)))).))))...)))))).))))|{{,...}}}}......||,.((((((((((((......)))))))).))))..,||{,(((((.....))))).},,}}},)))))))))...)))))))))).))...))))).)))))).)).,.}.))
Forensic Context

No forensic context available.