Basic Information

Symbol
hsa_AFF1_0014100
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-AFF1_0175
Host gene
AFF1
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
4:88047251-88053560 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
4:87126099-87132408 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-196.40 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -211.43 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 172.66
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((.....)))(.............((..(((((((..(((((.((..(((((..(((((...((..((((........(((..((((.........))))...))))))).)).)))))..)))))..))...........((((.....))))...)))))....((((((((....(((((..(((((((((.(((..(((((((((...(((...((((..(((((......)))))...))))...)))....)))))))))..))))))))))))....((((........))))))))).(((((.((((((((((.(.........))))).)))))).)))))..(((((.................(((...(((((((.((((((((.......((((((((......)))))))).)))))))).))))))).)))....)))))..)))))))).((((..(.(......).).)))).....((((((.........))))))..(((((......))))).........)))))))..))((((...(((.(.......(((((.((..((((((((((.((((.(((((((((((.((...)).)).))))))))).....))))...)))))..)))))....)).)))))(.((((((.(........).)))))).).......).)))...)))).........(((...))).)
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((.....)))(..........,.,{,..{((((({..(((({.,{..(((((..(((((.,.{{,.(({(....,,..{{{..((((........,)))},..))))))).)}.)))))..)))))..||,...|},....((((.....))))..,|||},....,,|{||||,...{((((..(((((((((.(((..(((((((((,,,({(..,((((..{||||....,}))}))}}.))))...}}}....)))))))))..))))))))))))....((((........))))))))}.(((((.((((((((((.{.........})))),,))))).))))),,||||.....,,,...{{{,...(({.,.(((((((.((((((({.......((((((((......)))))))).}))))))).))))))).)))....})))},{||||||||.{{((..,.,......}.}.)))}}}}}}||((((.........))))|,..(((((......)))))..,,.....}}}}}}}.,|,((((...(((.,.......(((({.,{..((((((((((.((((.(((((((((((.(,...,).)).)))))))))...}.}))).,.}}}},}})))))....}},))))){.((((((.,........}.)))))).}.......}.)))...)))).,,,,,...{((...))}.)
Forensic Context

No forensic context available.