Basic Information

Symbol
hsa_HDAC9_0014400
RNA Class
circRNA
Alias
hsa_circ_0079527 hsa_circHDAC9_017 hsa-HDAC9_0004
Host gene
HDAC9
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
7:18684294-18706099 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
7:18644671-18666476 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-248.8 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -264.24 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 139.57
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
..(((((((.......))).))))....((((((.......)))))).((((...(((((.((((.(((.(((((((((((((.......)))))((.....))((((...((..(((.....)))..))...))))))))))..)).))).)))))))))))))..((((((((((((....))).))))))))).(((((((((((((.((((((((((((((((((((...............(((((((..(((((....((.((((....)))))).(((..((((((.((........)).))))))..)))....((((......)))))))))..)))))))...(((((..((((.(((........))).)))).........((((.....((...))......))))((.((((((.((((..(((....((((((((((...((((((((.(((...(((((....((((.........))))....)))))....))).)))..))))).((.......)).))))((((((((((....((((((.(((...((....))....(((.......)))...(((.((((((((..............)))))))).)))..((((.((........))...)))).(((((((.......)))))))..))).))))))..)))))))))).....))))))....))))))))))))).)).....)))))....)))).)..))..)))))))))((((((((.....))).)))))))))....))))))))))))).....
Thermodynamic Ensemble Prediction
,.,,(({{,.......,,,.},,,....{(((((.......)))))}.((((...((((({((((.(((.(((((((((((((.......)))))((.....))((((...((..(((.....)))..))...)))))))))),.}).))).)))))))))))))..((((((((((((....))).))))))))).(((((((((((((.(((((((((((((,,,{(((,,,{.,{,..,....(((((((..(((((....{(.((((....))))}}.(((..((((((.{{........}}.))))))..)))....((((......)))))))))..)))))))...{{{{{..((((.{((,....,,.}}),)))}.....,,{,{{{{....,||,..,,.,...,||}|({.((((((.((((..{((....((((((((((...{{(((,{{.((({..,,,,|}}}.(((({{.......},||....||}}}....,}}}),}..)),)}.||....,,,)).))))((((((((((....((((((.(((...,,....}}....{{{..,,...}}},,.(((.((((({{(..,{.........,)))))))).)))..((((.{{,.,.....),...)))),(((((((.,....,))))))),,))).))))))..)))))))))).....))))))....))})))))))))).)).,,..))))}....)))).,.}))..)))))))))((((((((.....)))},))))))))....)))))))))))))....,
Forensic Context

No forensic context available.