Basic Information

Symbol
hsa_HDAC9_0015400
RNA Class
circRNA
Alias
hsa_circ_0004094 hsa_circHDAC9_019 hsa-HDAC9_0079
Host gene
HDAC9
Type of circRNA
Intron-Intron
Location (GRCh37)
7:18694386-18696610 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
7:18654763-18656987 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-537.2 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -582.26 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 594.78
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(........(((......))).....)((((((((.(((...((..(((((...((..(((.....((((((.....))))))..)))..))...)))))..))..))))))..........((((....)))).....((((.....((((((((((((((((.((........))..(((((.....(((((.((((((..........((((((....))).)))...((((..((.(((((((.((((((..........((..((((((((..((((.(((((((((...))))))..))).))))..(((.((((........)))).))).(((..(((((((((((...(((((((........(((..(((((((((((.(((((...(((((..((((((......)))))).((((.......)))).)))))..))))))).)))))))))..)))...........))))))).)))))))))))....)))........))))))))..))..)))).)).)))))))...))..))))((((((((((((..(((....((((((((.........(((((.(((((.........)))))..)))))))))))))........))).....))))...))))))))....))))))...))))).........((((....)))).....)))))....(((((((((...((((((((..................((((((((..(..(((.((((((.((.....)))))))))))..)..).)))))))((((((.((((((.....(((.....)))(((((((.....)))))))....))))))))))))..((((...........)))))))))))).(((.((((((((.............))))))))...)))...)))))))))(((((((((........))))))))))))))))))))))))).....)))).((((.(((((((((.((.((((...........(((((((((..(((((((..((..(((.(((((((..........((((((((.....((((((((((((((...(((....))).))))))))))...(((((.(((((((..............)))))))..((((.........((((((....(((((((((.....((((((((.....(((((..(((((...(((..((((((.(.((((.((......((.((.((((((((((.................((((.((..((((.......(((((.(((...(((((((.....((((((..(((((....................)))))...((((((.(((..(((((.(((....)))...)))).)..)))))))))....)))))).)))))))...)))))))).........))))..)))))))))))))))).)).)).......(((((((...)))))))..................))))))).))))))..))).)))))....)))))...))))))))....................)))))))))...))))))......)))).((((((((((...(((((..((((.....((((((((.((((((...........))))))........((((...(......)...))))((((((((((...))))))))))((((.(((....)))))))((((((..((((...((((...)))).))))..)))))).(((((..((((((((((.........))))))).)))...))))))))))))))))).))).)).))))))))))......(((((((.(((((....(((.((.....))...)))))))).)))))))................(((((((((((((((((.(((.((.......(((((..((((((((.....))))).)))..)))))...........(((((.((((((((...))))))))..)))))(((..(((...............)))..))))))))))))...)))))))))))))............))))).......)))).....))))))))))))))).)))..)))))).))))))).....))))))))))).))))))))).))))..)))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(........(((......))}.....)(((((,{{{({{,,.{...,{{{{...{{..(({.....,(((((.....)))))},||}}..}|,,,|||||..,|,.||,|}|.,..,{.,.,(({(,,,,||},.....((((.....((((((((((((((((.,,,{{{{...||..,,,,,.,,..(((((.((((({..........((((((....})),})).,{((((..((.(((((((.(((((({{,...}}}.((..((((((({..((((.(((((((((...))))))..))).))))..(((.((((........)))).))),(((..(((((((((((...(((((((...,,,..,((..(((((((((((.(((((.((((,(({,((((((......)))))).{(((....,,,},))}),)))}.))))))),}))))))))..))}...,.......))))))).)))))))))))....))),.......,)))))))..))..}))).)).)))))))...))..))))|(((((((((((..(((....{(((((,...,,,,.{((((((.(((((.........)))))..)))))))}},}}|,.,....,))).....))))...)))))))}....))))))...))))).....,,,,.,,,....)))}.....,,,))}},.(((((((((...((((((((...,{...........,,{(((((((..{.{(((.((((((.((.....)))))))))))}.}..},}))))}|(((({{.{{{({(,,,.,{{{..,,.}}|{{{((((.,...)))))))....)))))))))))},.,,,,...........,}}})))))))).{{{.((((((((.............))))))))...}}}...)))))))))(((((((((........))))))))))))))))))))))))).....)))).{{{{.({(((((((.{{.((((.......,,{,(((({,{{{..{{(((((,,({..((((((((((({.......|,((((({{,...,,,{{(((((((((((...{{,....)}).))))))))))}..{({{,.(((((((,,,,....,,,,,.}})))))..,{({,.,,,{{{.{{((((,{,.((((({(((,,,{.{((({(((,,..,{((((,,({({{...|||},|,|||||{,|{{|.,|....{{((,{{.{|||||{{{{......,.......,}||||},|...,,}}},,))))|||||||||.,.{{{||||,,,,,||{{{,,,||{{|.....{{,{{..........,},,....{||||{.{{(..{((((.{({....)))...)))).|,,}}}}}})))....|||||}.}}}})))}}.,||||}}}.,,{,,,,,{,{,....,,|.||||,|||},.||,},{(({...(((((((...))))))).}}})..}})....))).}}))}|,,|||}||{{}||{||.||,{|.|||}}...,,)))))),,.,,,,.............|||||}}}}..,))))),..,,,{|{||.,,,||||||{...{{{{|,.|||{..,..((((((((,((({({,,,.......,)))))}||.,....,{{{...(,,,...},.,||}|((((((((({...})))))))))|,|,{{({,.,.,}}||||((((((..((((.,.((((...)))),))))..)))))).,}}|,.,||||((((({.........)))))))}}},...})))}))))))))}))),}},..}})))))))}}}.}}}}.{{{((((,{{({,....,,,,||,.....,...,}}))))},))))}}}....,,,.........,((((((((((((((((.(((.({.....,.(((((..((((((((.....))))).)))..)))))...,.,,{{{{{{{{|,||||((({,..}})))))}..}}}}}(((..(((...............)))..)))))))))))),..})))))))))))|{,......,,,.,}}}}.,,..,,}})).....})))))))})))))),))),}},}})),)}},}}}...,.))|||}}},,),)))}}}))).,,,,..)))))
Forensic Context

No forensic context available.