Basic Information

Symbol
hsa_FOXO1_0001600
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0030042 hsa_circFOXO1_002 hsa-FOXO1_0006
Host gene
FOXO1
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
13:41133646-41134997 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
13:40559509-40560860 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-419.10 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -443.91 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 276.14
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((...)))(........(((.((((..........(((((((.......)))))))((((((......))))))((((((.(((..........((((((((.(.(((.....((((....))))...((((((((.((((...............(((((.(((((((..((...((.((((.......((((((.((((..........))))))))))(((.....)))((((.........))))..))))..))..))..)))))))...))))).((((((((((.....)))))).))))(((....)))((((((......)))))).....(((((((.((...)).)))))))....(((((((((((((.((((((((((((..(((((((....)))))))))(((((((.......))))))).....................((((((.....((((.(((.............))).)))).)))))).)))))).......)))).))))))..))).))))..((((.......))))..))))))))))))...)))).))))))))....))))))))).....((((((((...((((((((....................((((((((((((((.(((((....((((.((((((.............(((((((((((((..((((.((((((((((...(((((((.......((..((...((((((....))))))))..))..))))))).))))).....)))))....))))....)))).))))))))).((((.((......)).)))))))))).))))...))))).)))......))).)))))))).....(((((.(((..((..((((((......)))).))..))..))).))))).......((((((((((..((((....))))......((((((.....((((......)))).....(((((((........)))))))...))))))..((((((.(...(((........)))..((((((.....((((((((.....((((.((((((......)))))).).))).)))).))))....)))))).((((.(((((((....)))))))..))))..).))))))..)))))))))).((((.(.(((..(((....((((...))))....)))..))))))))(((.(((.(((((((((..............)))))))))..))).)))..............(((((........)))))...)))))))))))))))))))).)))......)
Thermodynamic Ensemble Prediction
(({...}})(,{{,....(((,((((...,......{((((((.......))))))|((((((......))))))|{{(((,({{...|,,,,..{(((((({.(,(((,,...((((....))))...((((((({,((((....,...,||....(((((.(((((((..((...((.((((.......(((({(,((((.{......,.))))))))))(((,....))){(((.........)))}..))))..))..))..)))))))...))))).,{{{|||{({...,,|||}||.},,,(((....)))((((((......)))))).....(((((((.({...}).)))))))....(((((((((((((.((((((((((((..(((((({....}))))))}}(((((((.......))))))).....,,......||,....,||{|{{.....{{{({{{{,...,,,....,.}))}))}}.}}))},.))))))}......}))).))))))..)))))))).,||||,......}}))..))))))))))))...}}}}.})))})))})}}}}))))))}.....((((((((...((((((((....................,{{{((((,,{(((.(((((.,..((((.((((({.............(((((((((((((..((({.((((((({((...(((((((.......((..((...((((((....))))))))..))..))))))).}}})),}}}}))))).,,.}}}}....)))).))))))))).((((.((......)).)))))))))).))))..,))))).)))}......,,.})))}))},....(((((.(((..((..((((((......)))).))..))..))).))))).......{{|{{{{(({,.((((....))))......,(((((.....||||}.....|||,.|,..(((((((........)))))))...}||||}..{(({((,..,.{{|.,......)}),.((((((.....((((((((.,...(((,,{((((({....})))))).).))).))))},)))....)))))).{(((.(((((((....)))))))..)))},,|,|))))}.|}))|||}}||.,|{{,,.||,..|||}}},|||{.,,))))}},,,}|..}},,},,,(((.(((.(((((((((..............)))))))))..))).)))..,,,,.,......(((((........)))))...))))))))))))))))}))).}))}),,}.)
Forensic Context

No forensic context available.