Basic Information

Symbol
hsa_chr6_0029500
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-FOXO3_0033
Host gene
FOXO3
Type of circRNA
Intergenic-Intergenic
Location (GRCh37)
6:108882254-108882986 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
6:108561051-108561783 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-375.20 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -386.47 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 280.18
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((.......)).)((...((((.....(((.(((((((........)))))))((((.((((.((..((((((((.((((..((((.....)))).)))).)))..((((...)))).(((.(((...))).))))).))))))))))))).((..((((.(((.(((((((((((..(((..((((.((((...((.((((((((.(.((((((((((.((((((((((.(((..((((((....((((((((.......))))))))))))))..))))))...........(((((.((((((((....(((.((.((....)).))))).((.....))...(((((...)))))((..(((((((((((.(((((.((((((.((((((......)))))).)))))).)))))((.((((((((((((((((.((...(((((.....)))))))))))))))..)))).........)))).)))))))))...))))..))..))))))))...)))))....((((.((((((.(((((((.((.((((..(((......)))..)))).))))))(((((((...)))..))))...))).)))))).)))).....))))))).)).))))))))..).))).)).))).))...)))).))))..)))...))))))))))).))).))))..))..........)))......))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((...,...}}.|((,,..(((.,...(((.(((((((........))))))){||{.{(((,({..{((({(((.{({(..((((.....)))).})||,|)}|.((((...}))),(({.((,...,)).))))).))}|||||||||},((,,({{{,(((.(((((((((({,{((({,((((.((((,{.{{.{|({(({,,{.{{{{{(({{{,((((({{||{||(({,((((((....((((((((......,)})))))))))))),}}|||||.,.,{{{....|||{{.||||||||,,},||{.||||||.},}}|}}}|}.||||...||...{||{{,,.})))}||,,{{({(({((((,(((((.((((((.((((((......)))))).)))))).))))){{(((,.((({{{{{|((,,{{,.{(((((.....)))))))})))}}})..))))..}}}...,}}}}.)}))}))))...))))},}}..}))))))),,.)}||}....,|||,(({({(.((((((((((.((((..(({,....,)))..)))).)))|}|{((((((..,))).|))))...}}},))))}}.)))),}}},))))))),)).}))))))).||,|||{||.,|}|))...))))}))))}}))},}}))))))))))),))),))))..)).........}}))}..,)}),)}))
Forensic Context

No forensic context available.