Basic Information

Symbol
hsa_FOXO3_0003500
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-FOXO3_0016
Host gene
FOXO3
Type of circRNA
Intron-Intron
Location (GRCh37)
6:108928849-108931723 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
6:108607646-108610520 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-807.90 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -866.24 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 709.24
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(.(((((.(((((..(((((...........((((.((((........(((((((((((((((((........)))))..)))...))))))))))))).))))........)))))...)))).................(((((((....)))))))......(((((.(((((.(((((((((((((..((((((..((..((..((((..(((((((((...((((((.((((((((.(((((((((..((.(((((((((..(((((((..(((..(((....)))))))))))))....(((((...((((((.(.((..(((((...(((((((((((.((((((.((((((((((.((.......)).)))))).......((((((((((((((...))))))).......))))))).(((....)))..(((.....(((((((((((((......((((..((((((......((((((........))))))....(((.((((((..(((((.((((((((((((............((((.((((.......))))))))..........)))).))))))).).)))))..))....)))).))).....))))))..))))(((((.((((((.....)))))).)))))(((((....((((((.(((((....))))).))))))..))))).......((((((((.....)))..((((((..(((((.((........)).)))))..)))))))))))..)))))))))))))..))).(((((.......)))))(((((((((............)))))))))...........))))..)))))).))))))))))).((((((.....))))))....((((((((((((.((((((((..........((...)).....((((((((((.((((....)))).)))))))))).))))))))........(((..((((((((...(((((((((((((((((.((((((......))))))....((((((..(((((..((((((.(((((((((((.(((.((((((((((.(((((((......((((......(((((((...))))))).......))))(((..(((.(((((((((((((((..........)))))))))).)))))..)))..)))((((.......))))(((........)))........((..((((((((((((((..(...((((((((.(((((....)))))..))).))))).)..)))))....)))))))))..))(((.....)))...))))))).))))))))..)))))..))))))..))))).))))))))))).)))))).....))).))))))).....)))))))....((((..........))))(.(((((.(.(((((((....))))))).)))))).).((((((((.(((((((...((((.(........)))))..)))))))...))))))))(((((((((((((((..(..((((((.....(((......))).(((.((......)).)))...))))))..)..).)))))).)))))))).))))))))..)))..)))))))))))))))))...)).).)))))).)))))))))).)))).))..)))))(..(((((((((.(((...)))))))).))))..).(((((((...)))))))(((((((((((.....)))))))...))))((((((.((((....)))).))))))..))))))))))...........((((((......))))))......(((((((((((((((.........)))))).((((((((.((((.(((...((((.(((((.((((((((((.((((.(((.(......).))))))))))).)).)))).))))).))))...))).))))((((...((((..((.((..........)).))...))))...))))((((....)))).)))))))).......))))))))).....((((....))))...(((..((((.((((((.....((((((((.((.(((.(((((.(........((((....))))).)))))))).)).))))))))..(((((...)))))(((.......)))....((.((((((.......))))))))..))))))))))..)))(((((((((((((((((................)))))))..))))))))))....)).))))))....)))).......((((((.(((....((..((((((...((.((......))))...))))))..))...))))))))).....))))))))).))..))..))))))..))).............((((.......))))...............))))))))))(((((((((((((((((...))))))))))....(((((.....)))))))))))).......((((.((((((((((.((((..(((((((...))))))).....).))).))))))))))))))((((((((((((((((.((.....((.........)).....)).))))).)))....)).))))))......)))))))))).......).)))))..)((((((((.............(((((..((((.((((((((((((((((((((((((....)))).....(((((((((...)))))))))...)))))..))))))).))))).......))).)))).)))))))))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(.(((((.(((((.,(((((...........((((.({{{....,.,.(((((((((((((((((........)))))..)))...))))))))))))}.))))........)))))...)))).................(((((((....))))))).,....(((((.(((((.(((((((((((((..((((((..((..((..((((..{(((((({....((((((,((((,((((((((({{{{..{,.(((({({{{..(((((((..(((..(((....)))))))))))))...,{|||{...{{{{{{,{.{{,,{{{{{.,.{{{{{{|{{{{.(((((({{(({((((((,{{..,,,,,|}.}|||}},,.....((((((((((((((...))))))}......,))))))),(((,...||,,,(({,...,(((((((((((((.....,{{{,{{{....}}},,},((((((........)))))).((((((((((,{(..(((((.(((((((({{{(....,.......((({{((((..,....}}}}}))),.....,...)))).))))))).).)))))..)),}}(((((((((...{(({..,(((((..(((((.((((((.....)))))).)))))(((((.,..((((((.(((((....))))).)))))),.))))).))))))))}.,..))))).)))).....,,.)))))))..{{{{{.,,.((((....)))),,.)),,},.)))))))))))))|,||||({(({.,,,,,{|}}},(((((((((..,,....},..)))))))))...........,}}}))))))},.))))}}}}))).((((((.....))))))...,(((((((((({(,{{{{((((({.{{,.{{{{{...{{,....((((((((((.((((....)))).)))))))))).,,||||||..|,,,,.{((,{((((,{((.{,((,{{{(((((,{{{{,,||||,{{{{{{,||||}..}|||||}}....,,,,,,,{(((({,,.{{{||||||||}|{||,,,,|||||||.,,.{{{{{{{{{|,,,,,.||{{{||,,,}}||}}|,,.....,}}))}},}||{,(((((((((((((({..........}))))))))).)))))..||||||}||{}||||..|.|||||{|,,,,|{{{{(({{{,,,{(((,.((((((((({((((,,(,,.{(((((({.{{{({.,,,))}}}..}}},,}}}}.,..))))}....)))))))))..}}|||.}}}}}}}}}}})}})})}}}}{|{{{,|}||||,.((((((({...)))))))).))))})}))))),.{{{|||{..||,,|{{{{{||||,,,.,.{((({{.,,..,.{{{{{.(.(((((.(.(((((((....))))))).)))))).).}}||||||}|||||((,,{{(,..|,}}},,..))))),,)))),,}...)))))))(((((((((((((((,..{..((((((.....{{{......})|{({..,,......}}.,.....))))))..}..,.)))))).))))))))),,})))))},},,..}))))))))))}))|||,|,}}.,.)})))),)})))))}}}.)))).,),,}))))}}.(((((((((.(((...))))))))},)))..},(((((((...))}))))||{{(((((((.....)))))))|,,|}},((((((.((((....)))).)))))).})))))}||||{,,,,,{{,..((((((......))))))..,,,.(((((((((((((((.{......,)))))).{{({{{((,((({{(((....(((,{((((.(((({,((({.((((.{((,,.....,),}}}))))),})})}.)))).))))))))...}})}.,)}))||||...|{||},}||||}||||}}}},,}})},,}}}}),..}}))||}}))).,,,,.))}))))),,,,,.,))))}}})),,..,((((....))),,,.(((..((((.((((((.....((((((((.((.(((.(((((.{........{{{,....}}),).)))))))).)).))))))))..(((({...}))))(((.......)))....{{.((((((.......))))))})..))))))))))..)))(((((((((((((((((.,,...,,.....}}.)))))))}},})))))))}....)},)))))}.,,,}}}},,,,,,,((((((.(((,{..((..((((((...(({(,......}}))...))))))..))}}.))))))))),,,))))}}})))).))..))..))))))..))),,,.,........||,....{{{{||,,........,}}}}}.}}))))))))(((((((((((((((({...})))))))))....(((((.....)))))))))))).......((((.((((((((((.(({{..(((((({...})))))).....).))}.))))))))))))))((((((((((((((((.({..,,,({.,,,...,.)}.....}).)))))}|)}....))},)))))......)))))))))).......}.)))))..}(((((((,............{(((((..((((.((((((((((((((((((({((((....)))).,,..(((((((({...})))))))).,,)))))..))))))).))))).......))).)))).)))))))))))))
Forensic Context

No forensic context available.