Basic Information

Symbol
hsa_chr6_0030600
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-FOXO3_0019
Host gene
FOXO3
Type of circRNA
Intergenic-Intergenic
Location (GRCh37)
6:109002056-109003430 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
6:108680853-108682227 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-331.71 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -358.44 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 415.85
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(..((((((((....(((........(((....))).((((((........)))))).......((.(((((((................)))))))))((((((((..(((((((((((...(.((((......)))).)..))))))).))))..).(((((....)))))...)))))))..((((...)))))))....)))))))).)((.....((((..........(((..((((.(((((((((..(((.(((((((((((.(((.((.(((......((((......))))..))).))))).)))))).(((((((((.((((...(((((...(((((((.....))).........)))))))))...((((...((.((((((((......))))))))))..(((((.((........)))))))..((((.........))))...................(((((....))))).......((.(((((((((((.....))))....))))))))).........))))(((((.....)))))........))))..)))).)))))............(((.(((((......(((....)))))))))))..((((...((..((........))..)))))).....))))).)))((((..(((((((..(((.((.((....)).)).))).......(((.(((.((((...)))).)))))))))))))..)))))))))))))))))....(((.(((((((((.(((((...)))))...)))))))))))).....)))))))(((((.(((((((....(((((((((.((((((((((....(((((.((..(((((((((....((((((((...................(((((((...(((((((((...(((((....................)))))))))))))))))))))..(((((......)))))...............)))))))))))))))))..))...(((((.((.((((......)))))))))))........(((((..(......).)))))..........(((...(((((((((....................................)))))))))....)))......((((((................))))))........((((((.((.........)).)))))))))))....))))..................(((.(((.((((((.((((...))))...))))))...))).)))...)))))).))))....))))).......))))))).)))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
{..((((((((...,{((,,....,,|||....}},.((((((........)))))).......((,((((((({(({,........,}|}||||}}}}(((((((,..(((((((((((...{.((((......)))).)..))))))).)))).,|.(((({....))))}..,)))))))..,||||,,,}},,}}.{|.}}}})))}.}{{.....,,,,..........{{...{(((,,(((({{{{..||}},,||||((({{.{{(,((.{((,.....{|||..,,.,}}))..))).))))),))))))}|||||||{{,((({{{.(((({..,((((({{.....}},........,)))))))))..|||||{{.((.((((((((......))))))))))..|{|{|||{,.,,....}}}})}}..{{{{.........}}},...................(((({....)))))........,.{|||||{||{{.,....{{{{{{{||}||}||,....,.....,,,|||||,....,,,}|,,{.,...,,))},}}||,|||||,.........,,(((.(((((......(((....))))))))))).,((({.((((,,{{.,,,.,{{||{,|||}},.{{{{||}.|{.||{(((..{((((((......((((({...}}.},,||,..{{,..(((.(((.((((...)))).))))))))))))),}))),))))))))))))),,,{(((.(((((((((.(((((...)))))...)))))))))))}.,,,.||{|}||,{{{|,,||||||.,{,({{{{{{||,||{{{,{|||,,..|||||,||,,||||||{{|,,.,{(({((((,{{{......,}},.....{((((((...((((((({{...{{{((....,..,.,,,........}}}}}})))}}}}}}}}})}|{.(((((......))))).},.......,}}},)}}}}}}))))))))))..}}...{(((,{((.((((......)))))))))))...,,,,,||}}|,,{{{,...{,|||||....,.....,,,...,,,||||||}.............,{{......||.{..{{{{...,,,,}}},,...)))).,}}},||||{|||.....}}}},..,{|||....}}}}}..{{{{{{.,,.,,......,}.))))))))})),...))}}.,.,,,.,{...,,{{{,(((.(((.((((((.((((...))))...))))))...))).)))...))))),.,}))}}..))})),..,},.))))))),)))))))
Forensic Context

No forensic context available.