Basic Information

Symbol
hsa_GCN1L1_0004900
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0028747 hsa_circGCN1L1_141
Host gene
GCN1L1
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
12:120576499-120585076 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
12:120138695-120147272 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-528.20 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -557.41 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 370.21
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((.(((((.(((.(((((((.(.((....))...).))))))).)))...((((((...((((((((....)).......)))))).)))))).............(((..((((((((((((......((((.(((.(((((.(((..(((((((.((....)).)))..))))..(((.........))).........((((((......)))..)))...((.(((((((((...(((.((.(((...((.((((((((...)))))))).)).)))))))))))))))))))....)))..))))).))).))))))))))).)))))..)))))))).)))..((((((.(((((((((((((((((((.(.((((((((((...(((.((.(((((((.(.(((....))).).))))))).)).))).)))))).(((((.((((((.((((....(((((.....(((..((((.......))))..))))))))...(((.......))).)))).)))))).)))))((((....)))).......((((((((((.(((((((((((((......(((......((((........))))......((((.(((....)))..)))).....(((((((((((.........)))))))))))(((((...............)))))(((((((...((((.((((((.(((((((((((((......)))).((((..((...))...))))(((((.(((..((((.((((((.(((((.((((((..........))))))))..(((........)))((((.......))))((((((((..(((((..(((....)))....)))))..)))))).)).))).)))))).))))))).)))))((((((((((.((.((......)).)))))..))))))))))))).))))))))))))).....)).))))))))......))))))))........((((((.......((((((...((((((((.((((.((.(.((((((.(.....).)))))).).)).))))..))))....................)))).))))))))))))......((((((......))))))((((((.((.((.(((....))).))...)))))))).)))).).))))...)))))))))).).))))))))...(((.(((......))))))(((((((....))).))))...((((((((.(((((((((..((((.(((((....)))))))))...)))..)))).))))))))))))))))).))))..)))))))(((((((...........((((....))))..(((((....))))).............)))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((.(((((.(((.(((((((.{.((....))...}.))))))).)))...(((({{...((((,,.|}}},(({{{....,,,)))}))}}}}...{,,,...|,,(((..(((((((((((({{,...{{((,(((.(((((.((((.(((((((.((....)).))},.||||..(((.(,....||))}....,,,..{,,{{{......)))..))},.,((.(((((((((...{{(,{|,.{{,..||,({((((((...)))))))).)}.,}}}}}}})))))))))))}..})))..})))).))},))))))))))),,))))..)))))})).)))..{{((((.(((((((((((((((((((.(.((((((((((...(((.((.(((((((.(.(((....))).).))))))).)).))).)))))){(((((.((((((.((((.,..(((({....{(((..((((.......))))..))))))))...(((.....,.))),)))).)))))).)))))|{{,....,}},.......(((((({{((,(((((((((((((...,..(((.{({({((((........}}}|,,{{,.((((.(((....)))..)))).,,,.{{{((((((({........,||}}}}))}))((((({{,..,,,{|{{{,,||||}{{{{{((,,.(((((((((((,((((((((({((((..{{{|||{{(((,..,,.,}))}},,,}}||||{.|||||{{{(,|{{(({.(({({.((((((..........)))))}}}.,|||,..,.,,,}})|||{..,,,,,}||}{{((((((..((((((,,((....)))))),.,})}..)))))).}}.}}}.)))))),)))))))}),,}}|||||{||||.||||{},,,,,})}}}}},..))}))))}))))),))))))))))))).,,,,)),))}}}))).,}...))))))))}.......((((((.......((((((...((((.((((((((.((.(.((((((.(.....).)))))).).)).))},.,))))}.,,.......,}.......)))),))))))))))))......((((((......))))))((((((.((.((.(((....))).))...))))))))..,}).).)})),..)))))))))).).))))))))...(((.(((......))))))(((((((....))).))))...((((((((.(((((((((..((({{(((((....)))))))))...)))..)))).}})))))))))))))))},))).)}))})})(((((((..,,,.,,,..((((....)))).}||{||,...,}}}}...........,.)))))))
Forensic Context

No forensic context available.