Basic Information
Symbol
hsa_GCN1L1_0006000
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0028755
hsa_circGCN1L1_135
hsa-GCN1_0080
Host gene
GCN1L1
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
12:120580311-120586150
UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
12:120142507-120148346
UCSC (hg38)
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-469.70 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-496.84 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
433.07
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((((((((((.(((((((((..(.....)..))).)))))).)))).)))..)))...)))(......(((......(((((((((((((.....(((......)))...((((((....))))))((((((..((((((((..((((.(((.......))).)).((((.............)))).(((.(((((((.(.((....))...).))))))).)))...))..)))))).))..))))))......(((.(((.((((((((.((.((.(((((..((.(((((((((((.(((....((((.(.((....))).))))..((((.((....)).)))).((((((((..........(((..(((((..((((((......)))..)))...(((.........)))..)))))..))).(((((.(((((((.((((.....((((((((((.(((((((...)))))))((...(((((...)))))...))...)))))))))))))).))))))).))).)).))))))))))))))).)))....((((((...(((.((.(((((((.(.(((....))).).))))))).)).))).)))))).))))))..))))))).)))))).)))).))))))..((((.......))))...(((((......(((((((........)))))))...)))))......(((((..............)))))...((((((((((......(((......((((........))))......((((.(((....)))..)))).....(((((((((((.........)))))))))))(((((...............)))))(((((((...((((.((((((.(((((((((((((......)))).((((..((...))...))))(((((.(((..((((.((((((.(((((.((((((..........))))))))..(((........)))((((.......))))((((((((..(((((..(((....)))....)))))..)))))).)).))).)))))).))))))).)))))((((((((((.((.((......)).)))))..))))))))))))).))))))))))))).....)).))))))))......))))))))))........))))))).))))))........)))((((((((.((.(.((((((.(.....).)))))).).)).))...))))))..)
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((,{({((((((.(((((((((.,(,....)..))).))}))).)))).}}},.,||,...,....,...|||......(((((((((((((.{...(((......)))...((((((....)))))){(((((.{((((((((..((((.(((,....,,||}.,|,||{{..}||||,,...,}}}}}|{{,|||{||{.,.||,,,,)),.,}.}}}}}}}.}}},,.)}.,)))))),}}.,}}}}||((.{{.{{{.{({.((((((((.((.({.(((((..((.(((((((((((.(((....((((.(,(,...,}}|.)))),.((((.((....)).)))}.(((((((({,{......,||{..{{{({.,{{{(((......)))..}}},..{{{||,||.,,,}}|,,|}|}}.,))},||(((,((((({{.||||,,,,.((((((((({.{{{((((,,.))}})))||...(((((...)))))...,}...)))))))))))))),))))))).))).,,.)))))))))))))))}}}}....((((((...(((.((.(((((((.(.(((....))).).))))))).)).))).)))))).))))))..)))))}).))))))}}))).)),}}}.,({({.......|||}...|||||,,....(((((((.,......))))))).{,|||}}.,,,..,{|||...........|,,})))|...{(((((((((...,.,(((.,{{{{((((,.,.....}}}},,||,.((((.(((....)))..))))..,,.{{{{(((((({.....,..,||}}}}))}))((((({{,..,,,{|{{{{{||||},{{{{((,,.(((((((((((,((((((((({((((..{{{|{|{{(((,..,,.,}))}},,,}}||||{.|||||{{{{,|{{(({.(({({.((((((..........)))))}}}.}|||,..,.,,,}})|||{..,,,,,}||}{{((((((..((((((,,((....)))))),.,})}..)))))).}}.}}}.)))))),)))))))}),,}}|||||{||||.||||{},,,,,})}}}}},,.))}))))}))))),)))))))))))}).,,,,)),))}}}))).,|,..)))))))))}........))))))).)))))).....}}}{..((((((((.((.(.((((((.(.....).)))))).).)).))}..,)))))..)
Forensic Context
No forensic context available.