Basic Information

Symbol
hsa_GCN1L1_0011700
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0028798 hsa_circGCN1L1_074
Host gene
GCN1L1
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
12:120592774-120611630 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
12:120154970-120173826 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1008.40 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -1050.40 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 787.73
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
..(.....(((((..((.....))..))))).)..((((((.(((((.(((((((........(((((((......(((.(.........).)))......)))))))(((((.....((((((.((((.((((((((((((((......)).)))))).(((......(((((((.....((....))..))))))).......)))....))))))))))..)))))))))))....((((((((((.((((...........(((((..(((((.((((((((...)))))........(((((((.(((((.((((..(((....)))....))))))))).)))))))........(((((((((........)))))).))).(((...((((((((.....((((((((..(((((.((.(.((.((((......)))).))).)).....((((((((((((...((.((((((........)))..((((.(.(((((((...))))))).).))))..((((((...((((.........))))..))))))(((((..((((((..(((...((((((....)))))).....((((((((((((.....((((((.(((((.(((((....))))).)))..((((((........(((((..(((((.((((((((((.((((.(((((..(((((....(((..((((....))))))))))))(((.(((((((((((((((((.((((((.....((((((....))).)))....)))))).....(((((..(((((.(((((.(((..(((.(((((.((........))..)))..))..)))...))).))))).))))))))))...((((((((((((.(..((((........))))..).))))).)))).)))...)))))).))))))))))).)))....))))).((((((.....))))))..(((..((((.(.....).))))..))).)))).).))))..)))))))))).....))))).((((((....)))))).)))))).((((((((((.((.(((.(((.((((((.(...(((((((((.(.(((.((((........)))).)))..).))))))))).).))))))....))).))).(((((.(((((.......)))..)))))))..((((((.((.((.(((....)))))(((.((((((..............(((((........)))))(((((.((.(((.(((........)))))).))..)))))...(((.((((.(((((...((((.((((((((((.(.((..((((..((((((.(.((..(((((.((...(((.....))).)))))))..))).))))))....))))...)).))))))...))))).))))..))))))))).)))..)))))))))))))))))(((((..((((((....))))))..))))))).))))))))))))))))))((((((((((...((((((.......((((((((.(((((((...(((((..((..((((.(((((((......(((((....)))))...((((..(((((.((((........((((.(((....))))))))))))))))..)))).(((((.....(((((((...((((..(((.(.(((((.((((((..((((....................)))).)))))).))))).).)))..))))((((((((((...((((((.(((.....)))..))))))...))))))))))....((((......)))))))))))..)))))((((((((((((.(((((((.(((((((((((.......))).)).)))))).)).))))))))).))))))))..))))))).))))))...((.((((((...(((..((((.....))))))).)))))).))))))))))).))).))).)))))))))))..(((((((((.(.(.......).).))))))))))))))).)))).))))))))))))((((((....))))))..((((.((((..(.((..((....))..)).))))).)))).................)))))))))..))))).))).)).))))))))))))........(((........))).....(((((((..(((.(((((((.......)))).)))))).)))))))(((((((((.(((((((..(((((.(((((....)))))..((.(((((..((.((...(((((....))))))).))..))))).)).)))))....))))))).)))))))))...)))))..))).)))))....))))))))...)))....))).)))))))))))))).)))))))))))).))))).)))))...((((.(......).))))))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
..{.,,..,|{((..{({{...|||||}}}},},.((((((,(((((,((({(({...,,,..{||,,,||,},,.{{{{((..,{{{..|{|||,....,|||}},,(((((.....((((((.((((.(((((((((.{((..(((((((.((.(((({{((({.....)))})}))).))..)))))))....))......}))}....})))))))))..))))))))))),,,.((((((((((.{{{(,......,,..(((((..(((((.((((((((...)))))......,,{((((((.(((((.((((..(((....)))....))))))))).))))))}}}.,..,.{{||{{{{{.....,..}}}}}},.,},(((...((((((((.....((((((((..(((((.{{.{.((.((({,.....}))).))}.}|,,,{{((((((((((((...((.{((.{{{{{.....,||{{((((,(,(((((((...}}}}))).},)))}.|{({(((...((({|{....,.|}|}}..}}}}}}{((({.,(((({,..{{||||((((((....)))))).....(((((((((((({{,((((..((((((((.({...,}.))))))))..)))))}{{(((,....((((({,{(({{{{.{,,{{{(((((((,({,(({,((((((,.{(((,.((((....))))||||||||(((.(((((((((((((((((,(((,{(({{{,((({{{,,((((.,|||,,,,}}},}}.....|{((|..,(((,,(({{{.,||,.|||..,|,..||||||..,.,||,,})}}}.}})),...||||}|}}}.,,)),)))))|,,|{,(((((((((.{..((((........))))..}.))))).)))).}}},..))))))},)))))))))).)))..,{|}}||{(({{((..,,,|}}|||...))}}}|||||,.}}}}}}})),.||||||{|||,((((,({{(({({{{{{..(((({{{.((((((....)))))),{{(,{,,{{|{||||((||{.(((.(((.((((((.{...(((((((((.{.(((.((((........)))).)))..}.))))))))).}.)))))}....))).))).{((((,({{,{......,})}.,))))))}..||||||....,,..)))|||||}}.,||,|||{{{.............,|||||,..,,,,,)))))||{{|,||.((,,(((........)))))).)),,|||||,,.{{(,((((,(((((...((((.((((((((((.(.((..((((..((((((.(.((..(((((.((...(((.....))).)))))))..))).))))))....))))...)).))))))...))))).))))..))))))))).)})..)))))))))}})})}}}|{((((.((((({....}))))))))),))})})))))}))),||||||}||{{{||||||}},|||||{..,{{{,(((({({({{{{{{{{||||{(({..|((((,{{,,{{{||||....||.,,|}}||}))},.,.{{{||||||||||{{{..|.{{{|((((,(({,{.,|}}}}}}}})},)}))}})}||.((((((((((((({{(((.....))).).))))))))))),)}.}},,(((({{{{({{..{((({{,..,.}))))),),|)}.||}}}.||||},.,((((((((((...{(((((.(((.....)))..))))))...))))))))))...||||,.}}}},))))}}}},,}..,,||,((((((((((((.(((((((.(((((((((((.......))).)).)))))).)).)))))}))).))))))))...)))}}))))}}|}||,||,,||||{,,||||,.||||,...,)))}})},})))})}}},})))))})})))}.))}))))))))},...(((((((((.(.{.......).).)))))))))}}}}})}}}},,))))))))))))((((((....))))))..||||,||||..(,{{..{{....)),.)},})))).))})...||....}}.,,..,)))))))})..)))))}))).}).)))))))))))}.......,|||||{,,...})}.,.,.(((((((..(((.(((((((.......)))).)))))).)))))))(((((((((.(((((((.{((,,({((((,....,},,)..((.(((((..((.((,..(((((....))))))).))..))))).)),)))),.}}}))))))).)))))))))...)))))..))).)))))....))))))))...)))....))).))))))))))}))).)))))))))),}.}}},},)),)},,,||,||||...}}))))).})))))
Forensic Context

No forensic context available.