Basic Information

Symbol
hsa_GCN1L1_0011800
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0028799 hsa_circGCN1L1_065
Host gene
GCN1L1
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
12:120592774-120613015 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
12:120154970-120175212 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1070.80 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -1115.33 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 793.38
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.((((((((((((((...(((((((.(((((((....(((((((((.((((((((((((((.(((((.((((....)))).)).))))))))))))....)))))..)))))((.((((((((.((....((.(((((((((............)))))))))...)).....)).).))))))).))))))))))).)).))..((((((.....((.((((..(((((((.........(((((.....((((.((((((......((((((.((((.((((((((((((((......)).)))))).(((......(((((((.....((....))..))))))).......)))....))))))))))..))))))..(((((((((.........((((.............)))).)))))))))(((((...))))).......((.(((((...)))))..)))))))))))).....)))))))))))))))).))....)))))).......))))))))))).))))))))....((((.((((.(((.((....)).)))..((.(.((.((((......)))).))).)).....((((((((((((...((.((((((........)))..((((.(.(((((((...))))))).).))))..((((((...((((.........))))..))))))(((((..((((((..(((...((((((....)))))).....((((((((((((.....((((((.(((((.(((((....))))).)))..((((((........(((((..(((((.((((((((((.((((.(((((..(((((....(((..((((....))))))))))))(((.(((((((((((((((((.((((((.....((((((....))).)))....)))))).....(((((..(((((.(((((.(((..(((.(((((.((........))..)))..))..)))...))).))))).))))))))))...((((((((((((.(..((((........))))..).))))).)))).)))...)))))).))))))))))).)))....))))).((((((.....))))))..(((..((((.(.....).))))..))).)))).).))))..)))))))))).....))))).((((((....)))))).)))))).((((((((((.((.(((.(((.((((((.(...(((((((((.(.(((.((((........)))).)))..).))))))))).).))))))....))).))).(((((.(((((.......)))..)))))))..((((((.((.((.(((....)))))(((.((((((..............(((((........)))))(((((.((.(((.(((........)))))).))..)))))...(((.((((.(((((...((((.((((((((((.(.((..((((..((((((.(.((..(((((.((...(((.....))).)))))))..))).))))))....))))...)).))))))...))))).))))..))))))))).)))..)))))))))))))))))(((((..((((((....))))))..))))))).))))))))))))))))))((((((((((...((((((.......((((((((.(((((((...(((((..((..((((.(((((((......(((((....)))))...((((..(((((.((((........((((.(((....))))))))))))))))..)))).(((((.....(((((((...((((..(((.(.(((((.((((((..((((....................)))).)))))).))))).).)))..))))((((((((((...((((((.(((.....)))..))))))...))))))))))....((((......)))))))))))..)))))((((((((((((.(((((((.(((((((((((.......))).)).)))))).)).))))))))).))))))))..))))))).))))))...((.((((((...(((..((((.....))))))).)))))).))))))))))).))).))).)))))))))))..(((((((((.(.(.......).).))))))))))))))).)))).))))))))))))((((((....))))))..((((.((((..(.((..((....))..)).))))).)))).................)))))))))..))))).))).)).))))))))))))..)))).))))(((((((((((.(((((((((((..(((.(((((((.......)))).)))))).))))))((((((((((.(((((((..(((((.(((((....)))))..((.(((((..((.((...(((((....))))))).))..))))).)).)))))....))))))).))))))))))..((((.((((..(((((.(((........))))))))..))))))))(((....)))..))))).))..(((....)))...))))))))).......(((....))).
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((((((((((((((...(((({{{.(((((((....(((((((((.((((((((((((((.(((((.((((....)))).))}})))))))))))....)))))..))))){{.((((((((.((....((.(((((((((...,....},..)))))))))...)).....)}.).))))))).}}))))))))).)).,}..((((((.{{.,({.((((..(((((((.........(((((.....(({{{((((((......((((((.((((.(((((((((.{((..(((((((.((.((((,{((({.....)))})}))).))..)))))))....))......})))....})))))))))..))))))..((((((({(,...,,...,,,({,....,}}....)),,.)))))))))(((((,..|}}}}.......||.{{{{{.,,)))})..,,)))))))))).....)))))))))))))))).)).},.)))))).......))))))))))).)))))))).....)(({(({,.(((.{(,.,,|}.}}),}|||,.((.((((,.....)))).)),.,|...,,((((((((((({...((.{{{.{{{||.....,||{{(((({(,(((((((...}}}}))).||))}}.|{(((((...((({{{......|))))..)))))}|(((,.,(((((,..{{{|||((((((....)))))).....((((((((((((||,((((..((((((((.({...}}.))))))))..)))))}{|{((,....{((((|,{(({{{{,{,,{{{(((({((,({{(({,((((((,.{(((,.((((....))))||||||||(((.(((((((((((((((((,(((,{(({{{,(({{{{,,((((.,|||,,,,}}},}}.....|{((|..,(((,,(({{{.,||,.|||..,|,..||||||..,.,||,,})}}}.}})),...||||}|}}}.,,)),)))))|,,|{,(((((((((.{..((((........))))..}.))))).)))).}}},..))))))},)))))))))).)))..,{|}}||{{({{((..,,,|}}}||..,}}},||||||{.|||}}}|}||.||||{{{|||,((((,(,{(({(,{{{,..(((({{{,((((((....)))))),{{(,{,,,,|,|||||||||.(((.(((.((((((.{...(((((((((.{.(((.((((........)))).)))..}.))))))))).}.)))))}....))).))).{{(((,{{{,{......,})}.,))))))}..||||,|....,,..)))|||||}}.,||,|||{{,.............,|||||,..,,,,.)))))|{{{|,||.((,,(((........)))))).))..})))|...{{(,((((,(((((...((((.((((((((((.(.((..((((..((((((.(.((..(((((.((,..(((.....))).)))))))..))).)))))),,..))))...)).))))))...))))).))))..))))))))).)})..)))))))))}}}})}}}{{((((.((((({....})))))))))})}}}|)))))}))},{{|{||}||{({|,,|||}},|||||{...{{{,(((({({(,{{{{{({||{|((({..{((((,{{,,{{{||||...,||..,|}}||}}|}..,,{{{|||{||||||{{{..{.{{{{((((,(({{{.,|}}}}},}})},)}))}})}||.((((((((((((({{(((.....))).).))))))))))),)}.}},,(((({{{{({{..{(((({,..,.}))))),),|)}.}}}}}.}}||},..((((((((((...{(((((.(((.....)))..))))))...))))))))))...}|||,.}}}},})))}}},,,,..,,||,((((((((((((.(((((((.(((((((((((.......))).)).)))))).)).)))))}))).))))))))...)))}}))))}}}}}||||,,||||{}|||||}.||||,...,)))}}}}|})))})}},,}))))))),)))}.)),)))))}}}},...(((((((((.(.(.......).).)))))))))}}}}}}||||,,||))))))))))((((((....)))))).,||||,||||..(,,,..{{....)),.)},})))).)}}}...||.,..}}.,,..,))))))))),.)})))}))).}}.))))))))))))..,}}},}}}}((((((((({{.((({(((((((..(((.(((((((.......)))).)))))).))))))|(((((((((.(((((((.{((,,({((((,....,},,)..((.(((((..((.((,..(((((....))))))).))..))))).)),)))),.}}}))))))).))))))))),..{(((.((((..(((((.(((.......})}.)))))..)))))))|(((,.{{.,...)),)))))........,))).}.}))))))))...,,.,}||,,.)))))
Forensic Context

No forensic context available.