Basic Information

Symbol
hsa_GCN1L1_0013800
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0028809 hsa_circGCN1L1_080
Host gene
GCN1L1
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
12:120596264-120608125 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
12:120158460-120170321 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-601.40 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -628.58 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 395.89
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(.(.(..((....))..)))((((.((...(.(((((((((((((.(((((.((....(((((((((.........((((.............)))).)))))))))....))))))).(((((.....((((((..((.....(((((.(((((((((...(((.((((((((..(((......(((((................)))))..))))))))...))).))))))))))))(((....))).....)))))..))..))))))))))).((((((...(.(((((.(.((((.(((.((((((.....((((((.((((((.(((........))).)))))).))))))((((((((((...((.((((((.((((((.((((.((((((...((((((((((((....))))))....))).)))...))))))((((..((((((((.((...)).))))))))..))))....(((((...(((((((((((........((((((.(((...(((.(((((((.(((((.((((....))))(((((((((((.(((((((((((((((((.((((((.....((((((....))).)))....)))))).....(((((..(((((.(((((.(((..(((.(((((.((........))..)))..))..)))...))).))))).))))))))))...((((((((((((.(..((((........))))..).))))).)))).)))...)))))).))))))))))).)))..(((..(((((..(((.(((((((((.......)))))((.(((....))).)).((((((..((((((..((((.......((((((..((((((....))))))((((.(....).))))(((((((((.(((.((((((.(...(((((((((.(.(((.((((........)))).)))..).))))))))).).))))))....))).)))...((((...........))))..))))))..)).))))........))))))))))..))))))................)))))))..))))))))))))..)))).(((.(((........)))))))))))(((((((...((((((((((((..((((((((((((((((.(.((..((((..((((((.(.((..(((((.((...(((.....))).)))))))..))).))))))....))))...)).))))))...))))).))....))))..)))))....))))))))))))))..((.((((.((((((....)))))))))).)).))))))).))).))))))))))).)))))))))))))).)))).))))))..((......)))))))).)).))))).))))).((.(((....))).))))))))...))))))))))))))...)))))).(((((((((.((.((......)))).))))))).)).))))))))))))).)))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(.(.(..((....))..)))((((.((..,{.(((((((((((((..((((((,(.{.((((,((((...,(({.,{{{{{,..{{{{,,,{,|},..}||}}}})){{{{{,..)))}},,,.....{((((((.{((((.((((..(((....)))....))))))))}.))))))},}}}}.}}}},}}}}....,.{{{{,{(((|....}}}))),..)))).}...,)))),,)}}).}}}).).).}})))),}.,,.,{|},,,,}}},.((((((,..(.((((({(.((((.(((.((((((.....((((((.((((((,(((,...,,,,))).)))))).))))))((((((((((...((.((((((.((((((.((((.{(((((...((((((((((((....))))))....))).}})...)))))}((((..((((((((.({...}).))))))))..)))),..,{((((...((((((((((,....,..,((((((.((({..(((.(((((((.(((((.((((....))))(((((((((((.(((((((((((((((((,(((,{(({{{,((({{{,,((((.,|||,,,,}}},}}.....|{((|..,(((,,(({{{.,||,.|||..,|,..||||||..,.,||,,})}},.}})),...||||}|}}}.,,)),)))))|,,|{,(((((((((.{..((((........))))..}.))))).)))).}}},..))))))},)))))))))).)))..(((..(((((..((,,((((,,{{,...||..{{{({((.,.....)))}.))}((((((..((((((..((((.,.,...{{{((({,((((((....)))))){(((,{....}.)))}|||||,(((.(((.((((((.{...(((((((((.{.(((.((((........)))).)))..}.))))))))).}.))))))....))).))).{{(((,{{{,{......,))).,)))))),..}|})}}....,.,.))))))))))..))))))................)))))))..))))))))))))..)))).((,,(((........))))))}))))(((((((...({(((({(((((..,((((,((((((((((.(.((..((((..((((((.(.((..(((((.((...(((.....))).)))))))..))).))))))....))))...)).))))))...))))).)))}..))))},))),).,..))))))))))))))..,({((((.((((({....}))))))))),)).))))))).))),)))))))))}}})))))))))))))}.)))).))))))..((,....,)))))))).)).))))).))))).((.(((....))).))))))))...)))))))))))))}.|.)))))).({(((((((.{{.{|......)})).))))))).)).))))))))))))),)))))))
Forensic Context

No forensic context available.