Basic Information

Symbol
hsa_GCN1L1_0016400
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0028824 hsa_circGCN1L1_039
Host gene
GCN1L1
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
12:120600874-120615555 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
12:120163070-120177752 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-485.20 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -510.98 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 382.49
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((.((((.((((((((((...((((((((.....((((((((..((..((((..((.......(((((((..((...........)))))))))...((((((.(((........(((((((((.(((.........)))...(((...((((((((((.(((((..(((.....)))..))))).(((.((((....)))))))...(((((..(((((((....((((.....)))).....))))))))))))......(((((.(((.......))).)))))...(((((((((((..(((........))).)))))))))))))))))))))....)))((((((((...((((......))))......(((.(((((...((..(((.....)))....)).......))))).)))..))))))))((((((.(((((.((((....)))).)).))))))))))))))))))))).)))))))).))))..))))))))))..))).)))))...))))))))).).))))..((((((((((.(((((((((((..(.(((((((((((.....((((((.....((.((((..(((((((.........(((((.....((((.((((((......((((((.((((.((((((((((((((......)).)))))).(((......(((((((.....((....))..))))))).......)))....))))))))))..))))))..(((((((((.........((((.............)))).)))))))))(((((...))))).......((.(((((...)))))..)))))))))))).....)))))))))))))))).))....)))))).......(.((((((((((....))))))...)))).)((.(((.((....)).))).))((.(((.((((((......(((.(((.((...................)).))).))))))))).))).)).((((((((..((.((((((.((((((((..(((((((...((((.........))))..))))))).....((((((...((((((((((((....))))))....))).)))...))))))((((..((((((((.((...)).))))))))..)))))))))))).)))))).)).)))).))))))))))))))).))))))))))))(((.((((..((((....)))))))).))).(((((...((.....))))))).)))))))))))))((((((((.((((...)))).........(((....(((.(((.....))).)))..)))..))))))).)
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((.((((.((((((((((...((((((((.....((((((((..((({((({,,{{,.,....{((((({.,((.{.......|,}|}}}}}}}.,,{|{{,,,((({....{{((((((((,(..{{.......,.))),..}||}}}||||||||,,,||{{{..(((.....}}}..})))}.(((.{(((....)))))))}}}||||({(((((({,,(.,(((((,,..|}||,.{{{||}}|||}|||,.{{{..,({((,(((,,,..{,||}.}||||,..(((((((((((..(((........))).))))))))))),,}}))))||.,,.||,,,{|{{|{,,.((((......)))).,,,..{{|,||{{|}..{|....{..,}}}))}.,..,}}}..,,)})))})))}.)))})|||((((((.(((((.((((....)))).))}}))))))))))),,))))},,})))})),,}))))))).))))))))..)))}}))))...))))))))).).)))).|((((((((((.(((((((((((..{.(((((((((((..,..((((((.{{.{({.((((..(((((((.........(((((.....(({{{((((((......((((((.((((.(((((((((.{((..(((((((.((.(((({{((({.....)))})}))).))..)))))))....))......}))}....})))))))))..))))))..((((((({(,...,,...,,,({,....,}}....)),,.)))))))))(((((...}}}}}.......||.(((((.,,)))}}..,,)))))))))).....)))))))))))))))).)).},.)))))),.|....,.(((({((((,....}}}))),..)))).|{{.(({.{(,.,,}}.}})||||{.{((.((((({......{{(.({{.,,..,|..||.......,},.,),))).))))))))}.})}.}}|(({(,{(({{((.((((((.((((((((,.(((((((...((((,{......}))))..)))))))..,..((((((...((((((((((((....))))))....))).)))...))))))((((..((((((((.({...}).))))))))..)))))))))))).)))))).)).}))))})))))))))))))).}))))))))))){{{.((({,,(({(,.,,}))}))}},))}.||||||..,,,,.}}}.,}}}}.)))))))))))))((((((((.((((...)))}.........{((....(((.(((.....))).)))..}}}..))))))).)
Forensic Context

No forensic context available.