Basic Information

Symbol
hsa_GCN1L1_0016800
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0028828 hsa_circGCN1L1_013
Host gene
GCN1L1
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
12:120600874-120628203 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
12:120163070-120190400 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-755.80 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -789.33 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 574.25
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((....((((......((((((((...(((..(((((((.(.((((((.(((((...(.((((((.(((((...(((...(((((((.(((((.((((((......))))))..(((((((...((((((.((((((...(((((((..((..(((((((........)))))))..))..))))))).))))))(((((.(((((((((...((((((((...((((((((..(((((..(((...........)))..)))))))))))))....((((.....(((((((((((((((((....(((((...)))))))))))))..(((..(((((..((.(((((.((.(((.(((.(((((....))))).)))))))).))))).)))))))..))).(..((((((((.(((((..((((((((((((.((.(((((((..((((((((.((.((((......)))).(((((......)))))..)))))))...))).)))).((((((((((.(((.....)))...))))...))))))..)))))..)))).....(((((((.(((.((((((((....)))))))))))((.(((.((......))))).))....)))))))))))))))...))))).))))))))..)..))))).))))..))))........)))))...)))..))))))))).))))))))))))))))))))))))).))))).))).......)))))..(((((((((.((((.......((((((.((((((((((.(((((..(((.....)))..))))).(((.((((....)))))))...(((((..(((((((....((((.....)))).....))))))))))))......(((((.(((.......))).)))))...(((((((((((..(((........))).))))))))))))))))))))).....(((.((.((((((((((......))))......((((.((((((((((((((...(((((((.(((((((....(((((((((.((((((((((((((.(((((.((((....)))).)).))))))))))))....)))))..)))))((.((((((((.((....((.(((((((((............)))))))))...)).....)).).))))))).))))))))))).)).))..((((((.....((.((((..(((((((.........(((((.....((((.((((((......((((((.((((.((((((((((((((......)).)))))).(((......(((((((.....((....))..))))))).......)))....))))))))))..))))))..(((((((((.........((((.............)))).)))))))))(((((...))))).......((.(((((...)))))..)))))))))))).....)))))))))))))))).))....)))))).......))))))))))).))))))))...)))))))))).)).))).))))))((((.((((((((((((((......(((.(((.((...................)).))).))))))))........)))))).))).))))..))))))))))).))(((((((...((((.........))))..)))))))(((.(((((....))))))))...)))))).)...))))).))))))((((.....((((..((((((((.((...)).))))))))..)))))))).((((((.(((.(((((((.....((((((((((..((((.(((((((((...)))....))))))((((((.(((.....))).)))))).))))))))))))))))))))))))))))))).)))))))................)))..)))))))).....)))).....))(........)
Thermodynamic Ensemble Prediction
((....((((,.....{({{{||{,,.(((..((((({{.,,((((((,(,{((,,,({({(((,..|||{{{((({.,.(((((((.(((((.((((((......))))))..(((((((...((((((.((((((...(((((((..((..(((((((........)))))))..))..))))))).))))))(((((.(((((((((.,.{(((((((...((((((((..(((((..(((...........)))..)))))))))))))...,((({.....(((((((((((((((((,(({{.(((.{{|||}|}}}||}||..{{{..({(({..{(.(((((.((.(((.(((.(((((....))))).)))))))).))))).)}})}))..}},.|.,|||{{{|{,|||{|,,||||||||||||.{({{((((,{({(((((((,{((.((((,....,)))).{((((......))))}..)))))))...|||.,.,,.{(((((((((.({{,...,)))..,))}},,})))))).,)))},..}))}.,,,.{((((((.{((.{(((((((....)))))))))))({.(((.({......))))).))}}},))))))))}}))))).,.,}}}),}))))}}}..,..}}}}},)))),})}}}........)))))...}))..))))))))).))))))))))))))))))))))))).))))),{{{{....{{{{|||{{(,{{,{(...,,|,..}}},.,|||}}}|||||(((((.(((((..(((.....)))..))))).(((.((((,...)))))))...{((({.,(((((((.,..((((,...,)))).....)))))))))))).,,...(((((.(((.....,.))).)))))...(((((((((((..(((........))).))))))))))))))))|}}||{{{,{{,{,(({{(({{,((((......))))......((({,(((({{{(({{(((...{{{{{|{.{{{{{{{...,||||,|||{.((((((((((((((.(((((.((((....)))).))}})))))))))))....)))))..)))))||,|||||||{.{|,,.,{|,||||||{({,,.,...,,,,.})}}|||}|,,,||,,,{,}|,|,|||||||.,|}||||||||,||.,|..((((((.{{.,({.((((..(((((((.........(((((.....(({{{((((((......((((((.((((.(((((((((.{((..(((((((.((.((({{{((({.....)))})}))).))..)))))))....))......}))}....})))))))))..))))))..((((((({(,...,,...,,,({,....,}}....)),,.)))))))))(((((...}}}}}.......||.(((({.,,)))})..,,)))))))))).....)))))))))))))))).)).},.))))))..,....}}|}}}}}}}|.}}}}))))...,}))))})}}.}}|}}|,}}}}},{{{{.((({((({((((((......(((.(((.,,..,|..{{.......,,,.}),))).)))))))),..,,...}||}|}||||.||}||||||}|||||||{|.(((((((...((({,{......}))))..))))))),||,{((({{{..,{{{||||{{{||,,,,})}}}),,,,}))}})){,{||}||,((((..((((((((.({...}).))))))))..))))))})}|||{||,||||||{||||,,,,,|||||||||||,{|||,|||{{{{((...||},...|))))}((((({.({{....,))).}))))).)))))))))}))))))))))))))}}))})}.})}))))..,,}}},,,..}}},),|||,}}}}))),.,,,)))),,...)}{........)
Forensic Context

No forensic context available.