Basic Information
Symbol
hsa_GCN1L1_0018200
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0028835
hsa_circGCN1L1_032
Host gene
GCN1L1
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
12:120607973-120616562
UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
12:120170169-120178759
UCSC (hg38)
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-338.00 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-356.61 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
257.15
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
..((((.....)).))..((((....((((((((((..((((..(((((....((((.......))))......((((((((..(((((....)))))((((((....(((((((.((((..(........((((....((((.((((((((((...((((((((.....((((((((..((..((((..((.......(((((((..((...........)))))))))...((((((.(((........(((((((((.(((.........)))...(((...((((((((((.(((((..(((.....)))..))))).(((.((((....)))))))...(((((..(((((((....((((.....)))).....))))))))))))......(((((.(((.......))).)))))...(((((((((((..(((........))).)))))))))))))))))))))....)))((((((((...((((......))))......(((.(((((...((..(((.....)))....)).......))))).)))..))))))))((((((.(((((.((((....)))).)).))))))))))))))))))))).)))))))).))))..))))))))))..))).)))))...))))))))).).))))..)))))..))))))))))).....))))))..(((((.........)))))(((((((......(((.(.........).)))......)))))))..........((((((.((((.((((((((((((((......)).)))))).(((......(((((((.....((....))..))))))).......)))....))))))))))..))))))..(((((((((.........((((.............)))).)))))))))))))))))...)))))....))))..))))))))))......))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
..((((,...,)).))..((((....((((((((((..((((..(((((....((((.......))))...||,{(((((((,,({(((.,,,}))}}((((((....(((((((.((((..(,,...,,.({{(.{..((((.((((((((((...((((((((.....((((((((..((((((({.,{{,......{((((({.{((.,.......|.)}}}}}))}.,,{||{,,,((({....{{((((((((,(..{{.......,.))),..}||}}}||||||||,,,||{{{..(((.....}}}..})))}.(((.{(((....)))))))}}}||||({((((((,,{(.{((((({{..|,||,.{{{||,}|||,|||,.{{{..,{{((,((({,,..{,|||.}||||,..(((((((((((..(((........))).))))))))))),,}}))))||.,,.||,,,{|{||,,,.((((......)))).,,,..{{|,||{{|,..{|....{..,}})))).,..,}}}..}}),)))})))}.)))})|||((((((.(((((.((((....)))).))}}))))))))))),,)))),,,}))),)),,}))))))).))))))))..))),}))))...))))))))).).)))).,)))))..)))))))))))..,..)))))),,((({(,,.,,,.,.}},,,|}}},.}}}))}.|{{{{{..{((({.{,||,,....)))))))}}.........((((((.((((.(((((((((.{((..(((((((.((.((((,{((({.....)))})}))).))..)))))))....))......})))...,})))))))))..))))))..((((((({(,...,,...,,,({{....,}}....)),,.))))))))))))))))}}..)))))....))))..))))))))))......))))
Forensic Context
No forensic context available.