Basic Information

Symbol
hsa_HIPK2_0003700
RNA Class
circRNA
Alias
hsa_circ_0082671 hsa_circHIPK2_018 hsa-HIPK2_0011
Host gene
HIPK2
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
7:139281463-139305309 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
7:139596717-139620563 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-340.6 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -358.51 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 299.47
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((........(((((((.....)))))))((((((((((((((............(((((((((....((((..............(((....)))(((....(((((((.........)))..................((((..(.(((((..((....(((...((((.((.(((.(((............(((((.......(((......)))........................(((......))).....)))))))).)))...)).))))...)))..))..))))))..))))........))))..)))(((........)))...))))))))))))).....)))))).......)))))))).(((((.((((...(((((((((((....(((((((..((((.......))))..))).))))..))))...((((..((..(((..(((((...((..(((((((((((((((((((((..((((.(((((....(((((...)))))...)))).).)))))))..))).)))).((((((((((.(((((..(((.(((((((....(((.(((((.((.((.((((..((.....)).))))..)).)))).))).)))))))))))))(((((...(((((..((..((((((((....)))))....)))..))...)))))..))))).((......))......))))))).)))).))))(((.((((((....))).....))).))).(((....)))...)))))))).))).)).))))).)))...)).)))).((((.((((......)))).))))..(((.(((......))))))...)))))))...((((.......))))((((.(((((..(((((...((((......)))).)))))..)).)))..))))(((((((...((((.........)))).((((((.(((((..(....)..))))).)))))).........))))))).(((.(.(((((...........))))).).))))))).))))).........)))(........)
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((....{(.(((((({,.....)|||||{((((((((((((((.{..........(((((((({...,((((.............,,{.{.,(({({{.....,|||||,,.......,}.....,..............((((..{.(((((..((....(((...((((.((.,,,{,(({{{{.......,(((((.......(({......,}}........................(((......))).....)))))),)})))}..)).))))...)))..))..)))))}..))))...,..,|}}}}.|||},||..,,}.....},..))))))))))))),,.,.)))))).......))))))))}{{|||,|(((,..(((((((((((....(((((((.,((((.......))}).,))).))))..))))...((((,,{{..{(({{((({(...,(,,(((((((({{{{{||||||||,,{(((.(((((,...(((((...))))),,,)}},|}.)))),||..|||,}||}.(((({{{{||,|{|||,,||{|,{|{(((,.{{(((.{({,,..|,{|}|||{.|||,....}},|||||,}|.||||{|}..,,|||||||||||(((,,..............,,,(((((....)))))....|||{.||{,.|||}||.|||||.|{.,|.,.}}......}}}}))),))))))}))(((.((((((....))).....))).))).{{{....))),}.))}})))).))).)),))))),)))...)),)))).((((.((((......)))).))))..,{{.(({......}))}},...})))))}...((((.......)))),{(({(((({..{|{||,},||.(({{.{{{|||{|.{{...,)},,.}}))))||,|||}.,|((((,.....,,.,,,,.((((((.(((((.,{....}..})))).)))))).........)}}}})}}||{.{.(({{(,.{.....,..))))).),))))))),))))),,,,},...)))(........)
Forensic Context

No forensic context available.