Basic Information

Symbol
hsa_GCN1L1_0020900
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0006344 hsa_circGCN1L1_016 hsa-GCN1_0002
Host gene
GCN1L1
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
12:120621372-120622690 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
12:120183569-120184887 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-120.40 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -124.90 kcal/mol
Frequency: 0.0007
Diversity: 50.00
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Forensic Context

No forensic context available.