Basic Information

Symbol
hsa_GFPT1_0004500
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0055043 hsa_circGFPT1_037 hsa-GFPT1_0025
Host gene
GFPT1
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
2:69565030-69577315 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
2:69337898-69350183 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-221.50 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -236.12 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 152.54
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((....(((.((.((((........)).)).)).))).((((((((...(((((.......)))))........(((..((((((......))))))...)))..))))))))......((((((((((.((((((((((...)))))))))).(((((((.((((((((((((((......))))))))).(((((((((((.((((.((((......(((...(((.(((....))))))....)))..)))).)))).)).(((((.....)))))(((((..(((..........)))..)))))...((.(((((.((((.......)))).))....(((((.......)))))..))).))......(.((((.....(((((.(......).)))))......)))).)))))))))).....((((((...)))))).....))))).))))))).((.((((.(((((...))))))))))).(((.(((((((((.(((((((.((((((..((((((..((((.(((..(((.(((....(((....((((((((.(((((((........))).)))).))))))))))).))).)))....))).)))).))))...))..))))((((((((...........)))))))))))))))))))))))))).))).......(((.(.(((....)))..).)))...))))))))))))(........)
Thermodynamic Ensemble Prediction
(,..((.({..{..(((..(((((((((.(((((((((((((((((...((((,{{{{{{.,,,)),,}}....|||,.((((((......))))))...}}}..))))))))......))))),,,,,.((((((((((...)))))))))).|||((((.((((((((((((((......))))))))).((((((((((,.((((.((((.((.,,{,{{,.{{(.(((....))))))|.,.,|)}.)))).)))).}}.(((((.....)))))(((((..(((..........)))..))))).,|{,.,||||.((((.......}})}.||....(((((.......)))))...}}.}.....,}|||||{||...(((((.{......,.)))))...,,,)))}.)))))))))).....((((((...)))))).....))))).)))}{((((.,((({,(((((...))))))))).}.))))}(((((((,{(((((((.((((((..((((((..((((.(((..,{{{{{(,.{((({..{.((((((((.(((((((........))).)))).))))))))}})))),}))},,..))).)))).})),,.,))..))))((((((((...........))))))))))))))))))))))))))))).)))))))))..)))...,,..})))...)((..|((((({...)))))).,..))
Forensic Context

No forensic context available.