Basic Information

Symbol
hsa_GIGYF2_0002300
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-GIGYF2_0094
Host gene
GIGYF2
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
2:233565295-233660931 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
2:232700585-232796221 UCSC (hg38)
External Database
circbank

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-542.50 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -582.09 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 507.48
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.......(((((((..((((((((((((..(((((((((......(((((((....((((((.(((..........)))))))))....(((((((.(((((....((((((.....))))))....))))).)))))))...............(((.(((((....)))))...)))......(((....))).((((..((.(((.(((((.....))))).))).))))))(((((((.((((.....((((((.(((((.....(((((.((((.((..(((...((((((..((.((...........)).))..))))))((((..(((((...(((...(((((((((((.....((((......))))(((((((((.(((((...(((((((..((((((((((((.(((((((((..((((((((....(((.((.....)).)))....))))))))..)))))..((((((((....).))))))).......))))...))))))))))))(((...)))......)))))))..)))))..)))))))))(((((.(.....((((....))))....).)))))........)))))))))))..))))))))))))(((......))))))..)))))).))))))))))..)))))).....(((((((......))))))).......((((((.....((.(((....................((((......))))((((..((((......))))..))))........((((.((((((((.((....)).))((((..((.(.(((((...((((.....)))).))))).).)).))))..(((((((.......(((((.(.((.(..((((((...(((((..((.((((....(((((..(((..(((((....)))))....)))......))))))))).)).((((((.((((..((.(((.......(((((((((.......)))))))))..((((((((((((..(((((((((....)))..(((((.......)))))...........((((.....))))..((((((.((((((.......((.....))...))))))))))))(((((((((...(.(((((((.(((..........((((.(((((((.((((......(((((...(((....))).))))).........)))).)).)))))...)))).((((.(((..........)))......)))).............)))..))))))).)....))))).)))).((((((....(....)....))))))...)))))).))))))))).)))..))).))..)))).....(((((((((((....(((......(((((...((................))...))))).......)))......))))))..)))))...........))))))...((.(((......))).)).....((((((((.....))))))))...))))).....))))))..).)).).)))))))))))).....))))))))))....))).))....)))))).)))).)))).))).))))))))))))))))((.((......)))).(((....)))..)))))))))).))....))))))).....((((((.(((..(((........))).)))...))))))((((.(.(..(((.(((((.........)))))....(((....))).....)))..).).))))(((.(((((..(((((......)))))..))))).))).......(((....)))..........
Thermodynamic Ensemble Prediction
......,(((((((..{{{(((((((((,.,,{{{{|{{|,,,,,{(((,{,.,||{,((((((((...{({{..{{{{{,,||{{,..,,.((((.(((((..,.((((((.....)))))).,..))))).)))}||{{{|||,,,.......{((.{((({....})}}}...}}}.,,...(((....))).,.(({{(.,(((((((((.....))),))))).,,,}},}}}}},.((((........))))|.((((((((((((((.((({{((..(((...{(((((..{{.((.{,......}.}).}}..)))))}((((..(((((...(((...(((((((((((..{{,((((......}},,{((((((((.,((((.{{(((,,.({((..(((((((((.{((((((((..((((((((....(((.((.....)).)))....))))))))..))))).{((((((({....}.)))))),,}.....}})),..))))))))))))|}}}}.)))|.....||||||}..))))),.))))))))}|||||,|.....((((....))))....}.})))}.....,,.)))))))))))..))))))))))))(((......))))))..)))))).))))),.))))))))).).....(((((((......)))))))....,{|||{{,,,,{{{,,{((,,.....,,.,}}}},.,,.|||||}}}}},,)))|||},,|||}}}}}}...))}}))))....,{{|{|||.|||{..,,..)))).,,.,|||,,.,,|.....,,,.,.{{||,,...,}}}..(((((((.(((((((..................}}}}}))....{(((((.(((.((((((.(((,.,.((((((,.{{{{,.(((((....)))))...,}}((((((((((((({{({(((((((((.(({,,(.,.{{((((..({(((,,,((((..,{((||.,,}},)},,..}))}..}},,)},.})}.)))....||||,|(((((.(((((({{({{...,...,.{{((,....}}}}}}}.....|||||,,{{(((((((..(((.{{,{(({{{.|,,,..}}))})))..)))))))||||{{,{......,,},.}}},}).,)))))))))}}.}}}}......}}..)),))))))))))))))},))|(((((((((.(((..(((..{(((.({{.,..,,,.|,||}......}}}}.....,...............|,,,............,,,{,(((({(,,..,...,|{{,.}}}}}}...,.))))}))})},}))}))},,.))))))))))))}...))))))){(((({,..{{......|})))))}((,,..{{{,..,.....,}}{((...........)))((((((((((,,.((.((({......}})}))},,,...,{{(,,.,},{{|||{|{{,...((((((((.....)))))))).,,{|,.,.,|})))))).,.....}..))))))))))}}}}..)))).)))))),.,,)))...))))))))).)))))})))))))..,}}}|||||}}}}}}|((,((..,,.,))}}.{{{,,,.}}}..}}})))}))}.))....)))))))..,.,{(((((.{{{.,{({,.......)}),)))..,)))))},...,{{{,,{,{.(((((......,..))))}...||}|...{||,....}))..,},|}}||,{{{.(((((..(((((......)))))..))))).}}},,.....|||},..}||....}}}...
Forensic Context

No forensic context available.