Basic Information
Symbol
hsa_DENND2A_0005900
RNA Class
circRNA
Alias
hsa_circ_0133567
hsa_circDENND2A_008
hsa-DENND2A_0004
Host gene
DENND2A
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
7:140273608-140302342
UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
7:140573808-140602542
UCSC (hg38)
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-547.2 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-576.16 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
416.88
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.((....((((....(((((((...(((((((....(((.(((...((((.(((.((((((.(((((..(((((((......((((.(...((((((....)))))))))))(((.(((((...............(.((((...((((.((((((((...)))))))).))))...)))).)((((((.....(((((...)))))......))))))..))))).)))....(((((.((((((((.....(((.......)))....((((...........)))).......))).))))))))))..........(((...(((((((.....))))))).)))(((((.((((.......)))))))))))))).))))))).)))))).))).).)))((((((...(((((....(((((.......(((...(((((.(((((....(..(((((((((((((((((.....((.((((.(...(.(((((((..((....((((..((((((........(((..((((...((((......))))..))))))).((((((((..(((((...)))))..((((.((((((.......(((((((((((.((((...((((((......((((..((((.(((..((((.((((.(((.(((((((....)))))..)).((((........))))....((((((((((....))).)).))))).))).)))).))))..))))))).....))))..(((((........)))))(((((.....))))).))))))....(((..(((((....((((..(((...)))..))))...))))).)))..(((((.(((....))).)))))..((((((.....((((..(((((((((....................)))))))))......)))).....))))))...)).))))))).))))))........)))))).)))).))))))))((((...(((.......)))...)))).)))))))))).))))))))))).))))))))))))))......)).)))))))..)......((((((((..(((........))).)).....))))))..(((((((..((((((......(((..(((((((((((((....))).)))).)))))))))....))))))....)))))))(((((((.((((((((((..((((.((((....)))).))))...))))...)))))).....(((.....(((.((.(((.(.....).))).))))))))......))))))).......))))))))))..))))))))......)))))....))))))((((((.............))))))((((((...............)))))).......((((((((......(((.(((((....(((.(((......)))...)))....)))))..)))........)))))))))))..)))..)))))))...)))))))...))))...))....((................))...
Thermodynamic Ensemble Prediction
((({...((((,.{(((,,{((|||{{{,.,|,,|{{...,||,,||{{{|}|{,((((((.{(((({{({({(((.{{..|||||,|},,((((((....})))}},}}}}|,|}|{|||,,,.,{{((..,,,.{.((((...((((.((((((({...}))))))).))))...)))),,|||(((.....{{{||,{{||||}......}))))),.)))))})}}....(((((.((((((((.....(((.......)))....((((...........)))).......)))}})))))))))......}}}}|((...(((((((.....))))))).))}(((((.((({,......}))))))))))))}.}||||||.|||||}.|}|||||},((((((...(((((....(((((.......(((...((((,,(((((....{..(((((((((((((((({....,((.((((.{...(.(((((({.,((....((((..((((({.{......(((..((((...((((......))))..))))))).((((((((..(((({...}))))..((((.((((((.......(((((((((((.(({(((((.{,((.,{...}},}}.)..))))|,{(((..,((((,,(((((((((..,,|}}},,.{{{((((((({{{{{((((.,{.((((((((((....))).)).))))),,|,,..((((((.,.....,.)))))).})))})|||{...,,}}}.,((.(((((.....))))))),))))}..,||{||{|{||..,}||||.,|||,,,)}),,))))...)))}}.}}}..|,|||}}}}.}}}),}.,))))..((((((.....((((.{{((((((({..............,.....}))))))))......)))).....))))))......))))))),,)))))........)))))).)))).)))))))){(((..,({{.......)))...))))})))))))))).))))))))))}.))))))))))))))....,,)),}))))))..}......((((((,(..(((........))).}}.....))))))..(((((((..((((((......(((..((((((,((((((....))).)))).)))))))))....))))))....)))))))(((((((.(((((({(({,,((((.((((....)))).))))...)))},}.)))))).....,{(|,...(((.((.(((.(.....).))).)))))})}...,..))))))).......)))))))))),.)))))))),,,,,,}}))}....)))))).,{{{(|,.{{{......,||,||{((({{.{,......,}.)}}})}))),...,||.((({((((.....,((,.({{({.,.|({|,|||...,,,},},..)))....))))),,)))}},,,.,,)))))))),,)},.}...|||||||{..||||||,...}}},....,,,,})}..}}}}}}},.....})..,,
Forensic Context
No forensic context available.