Basic Information

Symbol
hsa_ABCA1_0008600
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-ABCA1_0093
Host gene
ABCA1
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
9:107591353-107602761 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
9:104829072-104840480 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-361.80 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -382.85 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 329.72
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((((((((((.(((((.((...((((((((((.((...((((((.......((..(((((..((...((.((((((.(((((.((.(((.((((((..(((....(((.((((.......)))))))........((..(((.((....)))))..))(((.((((((.(.((..((................))..)).))))))).)))...(((((......))))).(((......))).((((((.(......).)))))).)))..)))).)).))).)).))..))))))))).))))..))))).)).(((....))).((((((.....((((.......))))((((.....(((((((.((((((((((((((...(.((.(((..(....)..))))).).))))))...)))))))).))))))).....))))...(((((...((((((...)))))).)))))))))))...))))))...)).)))))))..))))).))))).)))....))))))).((((.......)))).))(.((((((...((((((.(((((...(((((...((.((((((.(((((((((.....((((....((((((...((((((((.(((((.(((((((((((((.((((..((......((((.......))))......))..)))).))).......))))))))))((((((.(.((((....)))).).))))))((((.(((..((((.....))))((((((.....))))))((((..((((((........(((....)))..))))))..)))).))).))))..........)))))))).)))))..)))))).))))))))..((((((.((.(((.....)).).)).))))))((((((((.((.........))))))))))......((.((..((((((....))))))..)).)).....((((((...(((.(((((...........))))).)))....))))))))))).))))))))))))).((((.((........))))))))))).))))))...)))..))).)
Thermodynamic Ensemble Prediction
{{((((((((((.(((((.(({.,{{{(((((((.((...((((((.......(({,(((((,,{...(((,(((((({,(((({(,{((({((((((..(((,,..(((.((((.......)))))}}........{,..({{{((....))))}..||(((.((((({{(.({..({...,,,,...,.....}}..}}.})))))}.)))...||{||,,....},.,,,|||}},..,))),{(((((.{......}.)))))}.})}..}))).}).))).}}}|||.|.,))}}}}.}}}|,,}}}}}.||,(((....}}}.||{{.{|,..,||||,..}}.})}))}|||.....(((((((.{(((((((((((((...{.((.(((..(....)..))))).}.))))))...)))))))}.))))))).,...|||.{.{(((((...((((({...)))))).)))))).).)),..))))))...)).))))))}.}))))).))))).)))....))))))).((((.......)))),||({{(,(((...((((((.(((((..{(((((...{,.((((((,(((((.{,,.{{{{((,({{...((((({..,(((((((.{((({.((((((((((.(,(((.....(({...{((((({.....,..........,)))))))..)}}))}}.)))))))))){(((((.|.((({....)))).}.)))))}{(((.(((.,((((.....))))|(((((.....)))))}((({.,(((((({,.,,...,{{...,)})}.)))))).,)))).))).)))}..........)))))))).)))),{(({,.(({{{{{{{....,,,,|}}||}|||..}.})).}}))}))||||((((((((.((,,.....,.)))))))))).{{,..{(.((..((((({....})))})..}}.}}...}}|||{|||....|,,.|}),))))....))))))).))))}).,,},))))))).))))))}})))))}(((,,{{........))))))))))).))))))...))).}})),)
Forensic Context

No forensic context available.