Basic Information
Symbol
hsa_GIGYF2_0023000
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-GIGYF2_0250
Host gene
GIGYF2
Type of circRNA
Intron-Intron
Location (GRCh37)
2:233695387-233695910
UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
2:232830677-232831200
UCSC (hg38)
External Database
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-139.20 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-148.96 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
99.85
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((......))((......((((((((((((.((((((.....))).)))...))).....((.(((((((.(((((((..(..((((((..((((((((((....))).))))).))....))))))..).)))))))...............((((((.(((..(((((....((.....))...))))).)))..))))))))))))).))(((......))).......((((((((((((((...(((......)))...)).)).))))))))))...)))))))))...(((.((((((((((((((.((.....((((..(((((((((..(((((..(........)..)))))..)))))))))..)))).....(((((.....)))))...)).))))))))))))).).)))(.((((......)))).)((((....)))).....((..(((((((.(((......)))))))))).))......(((((...........)))))..))
Thermodynamic Ensemble Prediction
((......))((......(({{((((((((.((((((.....)))}}))...})),....,{.{{{{{({.(((((((..(,.((((((..((((((((((....))).))))).))..,.))))))..),)))))))...............((((((.,..{{(,,,...}}},...}}))}}.}},,,...,{{|||||||}},,,,.,|(((......))))}}})}}||((((((((((((...(((......)))...)).)))))))))))}}...}}}}}}}}}..,{{(.((((((((((((({.({.....((((..(((((((((..(((((..(........)..)))))..)))))))))..)))).....(((((.....,}}))...)).})))))))))))).).}},{.((((......)))).}{{{{....)))).,},.||..(((((((.{{{......}},))))))).,,......(((((...........)))))..))
Forensic Context
No forensic context available.