Basic Information

Symbol
hsa_chr4_0621100
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-AFF1_0065
Host gene
AFF1
Type of circRNA
Intergenic-Intergenic
Location (GRCh37)
4:87959740-87960316 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
4:87038588-87039164 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-157.40 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -168.54 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 204.90
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.......(((((.(((...((((((...(((((.(.((.(.(((((.((.(((((.((.((((......))))..)).))))))).).)))).))).).)))))))))))))).))))).......((((.(((.(((((((((((((((((((..((.....)))))))......((((((...)))))).(((((...((.((((((..((...........))..))))))))...))))).(((((((((.((((.((((((((.......(((....(((((.........)))))..)))))).)))))..))))(((.(((((.........(((((....)))))))))).))).)).))))))).((((...((((((........(((.((......)).)))...))))))...)))).....((((((...((.((((.((((((......)))))......).)))).))......)))))).....))))))))))))).((((......((.((.(((((....))))).))..))...)))).........).))))))).
Thermodynamic Ensemble Prediction
(,...,.(((((.(((...((((((...(((((.(.((.(.(((((.((.(((((,((,{{((......)})),,},.))))))).},)))).))).).)))))))))))))).))))}.....((,{(((((.{{((((.{(((((((,,,|}}}||},.}})),|||||.,...((((((...)))))){{{|}},.)}))||||||.}|,........,,,}|..|||||,{{.......,{{{{{{{|,||.,,,.,}|{{{{{.,||(((((..,,,{{(((.....,,|{,}|||{{(,{,,,.{||||||}|,,,{({({((({.....,,{.{((((....(((((,...)))))...,,))))}.,|(({,...}))}....,,..{{{{(({,,{{,|,{|||{,,,||,}|,,{||||.,,,,||||||,},|{,|||{.||,|||,,,...)))))}},,..},)}}},}}..........,.....,|||,{{,.,,}),,}}}}})})).)))}))|||{{...,))))),,....))))))}},,,,,)},,)))}.)))))
Forensic Context

No forensic context available.