Forensic RNA Knowledge Base

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.

Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.

Minimum free energy

-167.00 kcal/mol

Thermodynamic ensemble

Free Energy: -179.56 kcal/mol

Frequency: 0.0000

Diversity: 183.34

MFE Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

(.(((.((((((........(((.(((((((((((.(((.(((((((...)))))))...((((((.(((((((((.(((((.(((.......(((((...)))))((((.........)))).......(((...)))........((((((...))))))..(((......))).......(((...))).......((((((...........))))))))).))))))))))..(((((.((((((((.....))...(((....)))(((.(((((.((...)).))))))))...)))))).)))))...(((((((........(((.........)))........)))))))......((((((.......................))))))..))))))))))......)))))))).)))))).)))))))))))).)(((.......((((((.....(((((((..........)))))))...)))))).....((((((((........)))))))).......((((((((....(((((..(((.......))).)))))....)))).))))((((((.(((.(((.......))).))).))))))..((((......))))((((((.......)))))))))

Thermodynamic Ensemble Prediction

{...,,((((((...{(({((,,.,||||||,{,,.,,,,(((((({...)))))))....,{((({,,.})})|{,|,,|,.,||,...,,{(((((...)))}}|{{{,{,...,..}}}}.....}}}}}||{(((({.,,...((((((...))))))..(({......)}}..,,,......(((((..{,,,(((((((.{.........))))))).)...)}.))))).,(((({.((.(((((({((.{{{.{(((,...,.,(((.(((((.((...)).)))))))).....|||}..,}}}...(((((((.,......{{,.........}))......}.))))))),{{{{{((.,..{((.......((((((((((..((((........)))),....))))}})))))..,.,,,,.,...,,|}|,,,...{{{{..,,,{{{{{{.....(((((({..........}}}})))...)))}))}}..,}}||,,,,.}}}....))))))))......(((((((((....(((((..{{{.......}}}.)))))....)))).))))),||||.|}}.}}}))))}}.,,)},,..}))))),,,.,)))))))}.,.((((((.......)))))).,}

Basic Information

Secondary Structure

Structure Prediction

Forensic Context