Basic Information

Symbol
hsa_chr16_0078100
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-HBA1_0002
Host gene
HBA1
Type of circRNA
Intergenic-Intergenic
Location (GRCh37)
16:223497-227441 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
16:173498-177442 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-212.60 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -220.38 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 139.25
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.((((((..((.(((((.(((((...((........))..))))).))))))).((((((.(.(.....((.(((.....))).))...).).)))))).((((((.(...((((((((((((((.((((((((.((...(((........)))...)).))))..(((((((..((((.(((..(((.(.(((....))).)..)))..))).))))(((((..(((((((((.....)))))).)))..))))))))))))..)))).))))))))))))))).)))))).((((((((.........))))))))....((((((.....(((((((((....(((((.(........).))))).))))))))))))))).......((((((((....((((.(((......)))))))....))))))))))))))(((((((((.(((.(((...)))))).)))))...))))...
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((..(,,{(.{((,,.}|}.,}})}..))))...(((((((((((((((.((.((((({,,{.,.{((((((..{{{(((((((..{(((,.{{{|},,{{|||,..|.((((((((((((((.(((({{((.({,{,(((..,,.,{,||}..,||,||}}..||{{{{{,.((((.(((..(((.(.(((....))).)..)))..))).)))).(((({,{((((,,,,.,},}))))))}))),.))))))))}}))..)))).)))))))))))))).,)))))}..)))))))))..)).)))))}.,||,{,.((((((.....{((((((((.,,.(((((.(........).))))).))))))))))))))).......{(((((((..|.((((.(({......)))))))....)))))))),,{{||,,|,,|,}|,}))))).)).)))....))))))))))))...
Forensic Context

No forensic context available.