Basic Information

Symbol
hsa_HECTD1_0009600
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0031459 hsa_circHECTD1_065 hsa-HECTD1_0056
Host gene
HECTD1
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
14:31581622-31602881 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
14:31112416-31133675 UCSC (hg38)
External Database
circbank circBase

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-773.80 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -824.46 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 552.26
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((.(((..(((.(((.((((((((......))))......))))))).)))((((((((((..(((((((((((((((((.(((((((((..............(((((..(((((.................((((((.(((((((((((((((....((..((((((((((((((((..(.(((.(((((((...(((((...........((((((((((((.((........)).)))((((((((((((.((......(((((((((..(((..((..(.(((((((..((((((((.((((((((....(((((.((((((((((((((((.((((..(((((((.((((((.((....))))))))))))..)))..)))).((((..((((.......))))..)))).((((.(.(((((((((((.(((((.(((((((....((........)).....))))))).)))))............(((...((((..(((((((((((((((((.......))))...((((((((.(((((((((..(((((..(.......)..)))))..)).)).).)))).))))))))(((((((((((..((((..........))))........(((((((((.((.....)).)))))))))..)))))))))))............)))))).))))))).))))....))).......((((((.(((((((..(((((.((((........)))).....(((((...((.....)).....)))))...)))))...))))))...).)))))))))))).)))))))))).....(((((.(((...))))))))..))).)))))))))))..((((((((((...)))))))))).......((((.((((...............))))))))..............)).)))))..)))))))).))))))((((((........))))))((((....)))).....((.((((.....(((((.((((...))))..)))))...)))).)).((((((...((((.((((((((((...(((.(((.((..(((...((((((.(..((((.......))))..).))))))((((...((((.....))))....))))(((((((((((((((((((((((.........((((((...((((((..((......((((((..((........))..)))))).((.(.(((......))).).)).......))..)))))).))))))((((((..(((...(((...((.((...((((((((..((((..(((.......))).((((((((((........(((((((......((.((((..(((.....(((((((...)))))))..))))))).))..)))))))))).))))).))....))))..)))).))))......(((....))).)).))...)))..)))..))))))...))))))))).))))))).(((((..(.((((..(((((((((((((((.((((((((...))).))))).))((((.((((...)))).)))).))))).)))))))).....)))).).))))).........(((.....)))..)))))))......((.((((((........)))))).))..)))..)))))))).)))))))))).))))))))..)).....((((.(((....))).))))....)).))))))).)..)).)))...)))))....))))...))))))))))))))......)))))))))))))).....))))))))))).))))).......((((((((((...((.((.((((((((.............))))))))))))..(((((((((.((.(((.((..((((.(((((.((.((.((((((((..(((((...(((((((..(....)..))))))).....)))))......)))).)))))).)).))))))))).))))).)).))))))...)))......((((.((((.((((((.....)))))).))))))))................)))).....)))))).........(((((......)))))..)))))))))))))((((.(........).)))).((((((....))))))......((((..(((((((..((((((((.(.(......).)...))))))))..)))))))..))))(((...))).(((((.((((((((((((.((((((..((...(((((..........)))))...((....(((......)))...)).))..))).))).))))))).))))).)))))..)))).))))))))))).))))))(((.(((((.....(((((......((...(((((..(((((((((....))))..))))))))))....)))))))))))).)))..........................))))))))))..)))))))))(((((((((...))).)))))).(((((...........))))).........))))))....)))))))............))))))))))))))...))).)))))........
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((((.(((..(((.(((.((((((((......)))),.,...))))))).)))((((((((((..,,,,(((((((((((((.(((((((((............{{((,,,{{((((({.........,....{{((((((.(((((((((((((((....((..(((((((((((,,,{(,,{.((,{(((((((..,(((({......}}}}}((((((((((((.((........)).)))((((((((((((.((......(((((((((..(((..{(..(.(((((((...{((((((.((((((((....(((((.(,((((((((((((((.{(((..(((((((.((((((.({....),))))))))))..)))..)))}.((((.{((((.......}))}.})))}.{{({.{.(((((((((({.(((((.(((((((.,,.,..,,....,)....,,))))))).)))))......,,.....,{{,{((((..(((({({{{({(((({(,......}|||...((((((((.{((({((({..{{{{{..|...,,,,),,)}}})},)}.}).,,))}),)))))))}(((((((((((,{,(((,.||.....,),.),,...,|.(((((((((.((.....)).)))))))))..)))))))))))......,.....)))))),))))))).))))....,,,......,((((((.(((((((,.(((((.((((........)))).....(((((...((.....)).....)))))...))))).,.))))))...}.)))))))))))).)))))}}))}},.,,(((((.(((...)))))))),.)))}}))))))))))..((((((((((...)))))))))).......((((.((((...............))))))))....,,,.....,,)).)))))..)))))))).))))))|(((((......,.))))),((((....))))....(((((((((((.((.....,},{((((((.{....(((({.((...((((((....{((......))}.))))))............,,....((((((.{..((((.......))))..}.))))))((((({.{(((.....}}))....,}}})))}},.{(((((((((((((((.,{{,..,((({((,..{((((({..,(,,,...{(((((..{(,,......}},,||||||,((.(,({{..,},.))).,.}}..{,...}}..}}}}})}))}}},,...,.,{{|,..})),.......{{..((((((((..((((..{({.......}}}.({((((((((........(((((((,,.,{,{{.(((,.,(((..,..(((((((...))))))),}))))})).}),.)))))))))).))))}.))....))))..)))).))))..}}..|||,...)))}}).}}.}}..,..,.,,}))})),,,.))))))))).)))))))})}))))}).))))))|((((((((((((((.((((((({...})).))))).))((((.((((...)))).)))).))))).)))))))...},.})))))},))))..,......(((({({..{{{{{({((((,{{({,{(.{(((((........})})}},|}..,{{|.,.}}))))),}.}))))))))}))))},.}}|,....||||}|}}}}}..||{|,,,..)})}.))))))).)..}}.)))...)))))....)))).,.))))))))))))))......))))))))},}}}}.....)))))))))),.}}})}...,|..((((((,{{{...{{.({.((((((((.............}})))))}}|||..{{{((((((.((.((({((...,{(,{((((,((,{(({{,,,,||},||,||,,.,{{{{{,..,....}.{|||,|||....})),))}}.},.},,)})))),}}},.)))))})}|,}))},.}),)}}}),...}}}......((({{((((.((((((.....)))))).)))))))),{{...,.........)))}.....)))))).........(((((......)))))..)))))))))))}}((((.{,.......},)))).((((((....))))))......((((..(((((({,,((((((((.{.,......).,...)))))))).,)))))))..))))(({...})).(((((.((((((((((((.((((((..((...{((((..........))))}...{(....(((......)))...)).))..))).))).))))))))))})).)))))..)))).))))))))))).)))))}|||.||||{...,.,,,,,.,....,,...(((((,.{((((((({....})))..)))))))))).}}}))))).,,,,||.||.......,..................})})},,))))..)))))))))(((((((((...))).)))))).(((((...........))))).........))))))....)))))))............)))}))))))))))...))).)))))........
Forensic Context

No forensic context available.