Basic Information

Symbol
hsa_HECTD1_0011200
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0031460 hsa_circHECTD1_064 hsa-HECTD1_0052
Host gene
HECTD1
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
14:31582310-31602881 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
14:31113104-31133675 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-734.10 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -784.36 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 571.36
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
..(((((((..((((...((((.((((......))))))))..))))((((((((...((..(((((...((((((((((.....(..((((........))))..)))))..)))))))))))..)).((((.((((((((.(((((((((((((((....((..((((((((((((((((..(.(((.(((((((...(((((...........((((((((((((.((........)).)))((((((((((((.((......(((((((((..(((..((..(.(((((((..((((((((.((((((((....(((((.((((((((((((((((.((((..(((((((.((((((.((....))))))))))))..)))..)))).((((..((((.......))))..)))).((((.(.(((((((((((.(((((.(((((((....((........)).....))))))).)))))............(((...((((..(((((((((((((((((.......))))...((((((((.(((((((((..(((((..(.......)..)))))..)).)).).)))).))))))))(((((((((((..((((..........))))........(((((((((.((.....)).)))))))))..)))))))))))............)))))).))))))).))))....))).......((((((.(((((((..(((((.((((........)))).....(((((...((.....)).....)))))...)))))...))))))...).)))))))))))).)))))))))).....(((((.(((...))))))))..))).)))))))))))..((((((((((...)))))))))).......((((.((((...............))))))))..............)).)))))..)))))))).))))))((((((........))))))((((....)))).....((.((((.....(((((.((((...))))..)))))...)))).)).((((((...((((.((((((((((...(((.(((.((..(((...((((((.(..((((.......))))..).))))))((((...((((.....))))....))))(((((((((((((((((((((((.........((((((...((((((..((......((((((..((........))..)))))).((.(.(((......))).).)).......))..)))))).))))))((((((..(((...(((...((.((...((((((((..((((..(((.......))).((((((((((........(((((((......((.((((..(((.....(((((((...)))))))..))))))).))..)))))))))).))))).))....))))..)))).))))......(((....))).)).))...)))..)))..))))))...))))))))).))))))).(((((..(.((((..(((((((((((((((.((((((((...))).))))).))((((.((((...)))).)))).))))).)))))))).....)))).).))))).........(((.....)))..)))))))......((.((((((........)))))).))..)))..)))))))).)))))))))).))))))))..)).....((((.(((....))).))))....)).))))))).)..)).)))...)))))....))))...))))))))))))))......)))))))))))))).....))))))))))).))))).......((((((((((...((.((.((((((((.............))))))))))))..(((((((((.((.(((.((..((((.(((((.((.((.((((((((..(((((...(((((((..(....)..))))))).....)))))......)))).)))))).)).))))))))).))))).)).))))))...)))......((((.((((.((((((.....)))))).))))))))................)))).....)))))).........(((((......)))))..)))))))))))))((((.(........).)))).((((((....))))))......((((..(((((((..((((((((.(.(......).)...))))))))..)))))))..))))(((...))).(((((.((((((((((((.((((((..((...(((((..........)))))...((....(((......)))...)).))..))).))).))))))).))))).)))))..)))).))))))))))).))))).)))..))))..(((....)))...((((((......))).)))((((.......))))...)))))))).((.....))................................)))).)))..
Thermodynamic Ensemble Prediction
..(((((((..((({,,,((((.((((......))))}))}..))))(((((({,,,,((,.(((((...((((((((({.....,..((((........))))..,},}}.,}}))))}})))..}}.,.,,,((((((((.(((((((((((((((....((..(((((((((((,,,{(,,{.((,{(((((((..,(((({......}}}}}{(((((((((((.((........)).)))((((((((((((.((......(((((((((..(((..{(..(.(((((((...{((((((.((((((((....(((((.(,((((((((((((((.{(((..(((((((.((((((.({....),))))))))))..)))..)))}.((((.{((((.......}))}.})))}.{{({.{.(((((((((({.(((((.(((((((.,,.,..,,....,)....,,))))))).)))))......,,.....,{{,{((((..(((({({{{({(((({(,......}|||...((((((((.{((({((({..{{{{{..|...,,,,),,)}}})},)}.}).,,))}),)))))))}(((((((((((,{,(((,.||.....,),.),,...,|.(((((((((.((.....)).)))))))))..)))))))))))......,.....)))))),))))))).))))....,,,......,((((((.(((((((,.(((((.((((........)))).....(((((...((.....)).....)))))...))))).,.))))))...}.)))))))))))).)))))}}))}},.,,(((((.(((...)))))))),.)))}}))))))))))..((((((((((...)))))))))).......((((.((((...............))))))))....,,,.....,,)).)))))..)))))))).))))))|(((((......,.))))),((((....))))....(((((((((((.((.....,},{((((((.{....(((({.((...((((((....{((......))}.))))))............,,....((((((.{..((((.......))))..}.))))))((((({.{(((.....}}))....,}}})))}},.{(((((((((((((((.,{{,..,((({((,..{((((({..,(,,,...{(((((..{{,,......}},,||||||,((.(,({{..,},.))).,.}}..{,...}}..,}}}})}))}}},,...,.,{{|,..})),.......{{..((((((((..((((..{({....,..}}}.({((((((((........(((((((,,.,{,{{.(((,.,(((..,..(((((((...))))))),}))))})).}),.)))))))))).))))}.))....))))..)))).))))..}}..|||,...}))}}).}}.}}..,..,.,,}))})),,,.))))))))).)))))))})}))))}).))))))|((((((((((((((.((((((({...})).))))).))((((.((((...)))).)))).))))).)))))))...},.})))))},))))..,......(((({({..{{{{{({((((,{{({,{(.{(((((........})})}},|}..,{{|.,.}})))))}}.}))))))))}))))},.}}|,....||||}||}}}}..||{|,,,..)})}.))))))).)..}}.)))...)))))....)))).,.))))))))))))))......))))))))},}}}}.....)))))))))),.}}})}...,|..((((((,{{{...{{.({.((((((((.............}})))))}}|||..{{{((((((.((.((({((...,{(,{((((,((,{(({{,,,,||},||,||,,.,{{{{{,..,....}.{|||,|||....})),))}}.},.},,)})))),}}},.)))))})}|,}))},.}),)}}}),...}}}......((({{((((.((((((.....)))))).)))))))),{{...,.........)))}.....)))))).........(((((......)))))..)))))))))))}}((((.{,.......},)))).((((((....))))))......((((..(((((({,,((((((((.{.,......).,...)))))))).,)))))))..))))(({...})).(((((.((((((((((((.((((((..((...{((((..........))))}...{(....(((......)))...)).))..))).))).))))))))))})).)))))..)))).))))))))))).)))))}})).,||||..,,...,...}..,{{{{{{.,.,,.})),}}|{{,....,}},,,)}}},)))))))).{,||...}),,,.............................)))).)))..
Forensic Context

No forensic context available.