Basic Information

Symbol
hsa_HECTD1_0020200
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0031476 hsa_circHECTD1_052 hsa-HECTD1_0038
Host gene
HECTD1
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
14:31596991-31605871 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
14:31127785-31136665 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-576.70 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -613.31 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 404.45
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.....((.(((((...((((.((((....))))))))..((((((((.((((((.(.(((((((.(((((((.(((.(((........))).))).))..)))))...((((.((..(((.(((((((.(((((.(((.((......)).))).)))))(((((.......(((((.(((((((((((..(((((...........)))))..))))....((((.((((((((.((....))))))))))...))))....))))))).))))).(((((......(((((((........)))))))......)))))......(((((...((((.((....)).))))))))).((((((........)))))).(((((((((........)))))))))((((.((((((.....((((.(((((((((.((((........))))))))).))))...)))).......))))))))))..)))))..))))))))))..))))))...(((.....)))(((((.((((((.(..((....))..).)))))).)))))..))))))).).)))))).)).....)))))).....((((..(((((((((((.((((......)))))))).....(((((..(((..((..(((((...((((((((((.....(..((((........))))..)))))..)))))))))))..))...((((((((((..(((.((((((((..(.((((.(((((((((((.((((((((((....)))....(((((((.......))))))).......(((((((((((...(((((((((...)))).)))))..))))).))))))............(((..((((..(((((((.((((((((....(((((.((((((((((((((((.((((..(((((((.((((((.((....))))))))))))..)))..)))).((((..((((.......))))..)))).((((.(.(((((((((((.(((((.(((((((....((........)).....))))))).)))))............(((...((((..(((((((((((((((((.......))))...((((((((.(((((((((..(((((..(.......)..)))))..)).)).).)))).))))))))(((((((((((..((((..........))))........(((((((((.((.....)).)))))))))..)))))))))))............)))))).))))))).))))....))).......((((((.(((((((..(((((.((((........)))).....(((((...((.....)).....)))))...)))))...))))))...).)))))))))))).)))))))))).....(((((.(((...))))))))..))).)))))))))))..((((((((((...)))))))))).......((((.((((...............))))))))..............)).)))))..)))))))).)))))))(((((........))))).((((....))))....))))..))).(((......))).(((((((..((.((((.......((((((....(((......))).))))))..)))).))...))))))).((((.(..((((.......))))..).))))(((((((..((((.....))))....))))))))))).))).))))......)))))))..)))))..)))...))))).)))..)))))).)))))))..))))).((((((((.((.(.(((......))).).))................((((((........((((...)))).....))))))(((((...........))))))))))))).)))))))..)))).....))))).))..
Thermodynamic Ensemble Prediction
.....((.((((({,,{{((.((((....})))))}|..((((((((.((((((.{.(((((((.(((((({,(((.(((,.......}}}.))},)),,|||||...{(((,({..(((.(((((((.(((((.(((.((......}).))).))))){|{{,...,,{{((((({((((((({(({..{{{{{...........))})}..})))}},,((((.((((((((.{(....})})))))))...))))..,,)))))))})}},..(((((,.,...(((((((........))))))).....,)})))}}}...(((((...((((.((....)).)))))))))(((((((..{{{...|||,||{((({((({(,,,,.,,.,||||||||,{{.|||||||,..|,|{|{.|||{|||{|}|{||}.,,,}}}))))))))}.||||,.,||||...,...}}))}))))).}))))},,})))))))))..}|)))}...{{({...}))}(((((.((((((.(..((....))..).)))))).))))),.))))))).).)))))).))}....,)))))},,..((((..(((((((((((.((((......))))}))}.....(((((..((({,((..(((((...((((((({((.....,..((((........))))..,}})).,)))))))))))..))...,,((((((((..(((.{(((((((..(.((((.(((((((((((.((((((((((....)))....{((((((.......))))))|..,,{{{(((((((((((...(((((((((...)))).)))))..)))))}})))))...}},,...,,(((..((((..{((((((.((((((((....(((((.(,((((((((((((((.{(((..(((((((.((((((.({....),))))))))))..)))..)))}.((((.{((((.......}))}.})))}.{{({.{.(((((((((({.(((((.(((((((.,,.,..,,....,)....,,))))))).)))))......,,.....,{{,{((((..(((({({{{({(((({(,......}|||...((((((((.{((({((({..{{{{{..|...,,,,),,)}}})},)}.}).,,))}),)))))))}(((((((((((,{,(((,.||.....,),.),,...,|.(((((((((.((.....)).)))))))))..)))))))))))......,.....)))))),))))))).))))....,,,......,((((((.(((((((,.(((((.((((........)))).....(((((...((.....)).....)))))...))))).,.))))))...}.)))))))))))).)))))}}))}},.,,(((((.(((...)))))))),.)))}}))))))))))..((((((((((...)))))))))).......((((.((((...............))))))))....,,,.....,,)).)))))..)))))))).))))))|(((((......,.))))),((((....))))....))))..))).(((......))).(((((((..,{.,(((.......((((((....(((......))).))))))..,),)}),...))))))),((((.{..((((.......))))..}.))))|((((((..((((.....))))....))))))))))).))).))))......)))))))..))))}..)))...))))}.)))..)))))).)))))))..))))).((((((((,((.(,({{..,}}.))).,.}}.,|,...}}}......((((({........{{{|...)))}..,..))))))(((((...........))))))))))))),)))))))..))))....}))))).)}..
Forensic Context

No forensic context available.