Basic Information

Symbol
hsa_HECTD1_0020500
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0031479 hsa_circHECTD1_045 hsa-HECTD1_0025
Host gene
HECTD1
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
14:31596991-31614147 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
14:31127785-31144941 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-686.00 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -734.70 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 468.63
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
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Forensic Context

No forensic context available.