Basic Information
Symbol
hsa_HECTD1_0023700
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0031483
hsa_circHECTD1_036
Host gene
HECTD1
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
14:31597818-31626216
UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
14:31128612-31157010
UCSC (hg38)
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-811.90 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-872.11 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
932.58
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(.((...........)))((((((((((..((.((.......(((((((((.....(((((((.(((.......(((((.((((((..(((....(((.....)))....)))...)))))).)))))((((((((((((((...(((((((....((....((((.....(((..((((((.(((((((.(((.........))).........((((..((......))...))))....(((((((...((((.((((((((.((((...))))))).))))))))).......)))))))(((((((((((((..(((((((((((((...((((....(((((((..((....)).))))))))))).)))))))))))))..........((((...((((.((((...)))).))))...).)))((((((((.(((((....(((.((((...((((...(((.((((((.(((((..((.((..........)).))...)))))..)))))))))))))..)))).)))..(((((..((((.......))))..)))))....................))))).))))))))..((((..(((......)))..)))))))))).))))))).....))).))))))))))...)))....)))).....(((.(......).)))..((((........)))).............((((((((((...(((((..(((((..((((((.((..((((......(((......))).......)))).)).)).))))..))).))..)))))..((((.....)))).(((((((.....((((((((((..............(((((....)))))((((((((((...((((((((..((((.....)))))))).))))....))))....(((((.(((((.....))))))))))((.((((.((((...)))))))).))..((((((((.....))))))))...(((((........(((((.((((((.(((.(((...((((.(((((......(((((((((((.......)))))..(((....))).....))))))))))).)))).....))).))).)).)))).))))).......))))).))))))))))))))))....)))))))............((((((...((((.(((....((((.((((....))))))))..))).))))..(((((.....)).)))(((((((.(((.(((........))).))).))..))))).....))))))...))))))))))(((((.(((.((......)).))).)))))))....)))))))((((.(((((((((((..(((((...........)))))..))))....((((.((((((((.((....))))))))))...))))....))))))).))))..(((((......(((((((........)))))))......))))).....))))))))).)))))...........))).)))))))........)))))))))(((((((((........)))))))))((((.((((((.....((((.(((((((((.((((........))))))))).))))...)))).......))))))))))...(((((.((.(.(..(((((((((....((((..((((.(((((.((((((.(..((....))..).)))))).)))))...(((((.(((....))))))))......(((((((.......)))))))((((((((.(((...(((((((......(((((...(((.((.........)).)))((........)).(((......))).))))))))))))..........((.(((((((..(((........))).))))))).))((((.(......))))).....(((....)))....(((((((.......))))))).......(((((((((((...(((((((((...)))).)))))..))))).))))))........))).).)))))))..(((((((.((((((((....(((((.((((((((((((((((.((((..(((((((.((((((.((....))))))))))))..)))..)))).((((..((((.......))))..)))).((((.(.(((((((((((.(((((.(((((((....((........)).....))))))).)))))............(((...((((..(((((((((((((((((.......))))...((((((((.(((((((((..(((((..(.......)..)))))..)).)).).)))).))))))))(((((((((((..((((..........))))........(((((((((.((.....)).)))))))))..)))))))))))............)))))).))))))).))))....))).......((((((.(((((((..(((((.((((........)))).....(((((...((.....)).....)))))...)))))...))))))...).)))))))))))).)))))))))).....(((((.(((...))))))))..))).)))))))))))..((((((((((...)))))))))).......((((.((((...............))))))))..............)).)))))..)))))))).)))))))))))..))))....))).))))))..).).)))))))..(((((.(((......))).(((((((..((.((((.......((((((....(((......))).))))))..)))).))...)))))))(((((.(..((((.......))))..).)))))..))))))).))..)))).))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(.((.,.........)))((((((((((,,((,((({{,,,{{{{{{{{(({,{,,(((((((,,,,.....,,{{{((.((((((,,({(,{{,(((...,,|}}..|,}}}...}}}|||,|}}||((((((((((((({...,{{{{{{,,..||,...((((.....,,...((((((.{{{{{{(.(((.........))}.,..{|,...{{{..||..),,.....})})),.,,|||||||,}}|||{.||||{,,,.,(({,,,|||||||,}||}|||||,,..,,.}}}}}}|(({{{{{((((({{.(((((((((((((...((((....(((((((..((....)).))))))))))).)))))))))))))}.,||||...,|||,..((({.{(((...}}}|.|}}}...,,}})||||||...||...}}},||,,||||,,,|{{{...,,{||{{{{|,||||(,,(((({........,,||,|}...}}||}..|||||},||||||,.}|}|,||,..,{{{|.,||,{..,,,,}))))},))}},,,,.......,,...,,,,.}}},,.|||||||.{{{(,|..,,,}}}}.,)))}}))..}}))))))}})))),}...}}},,,)))))))}...,}}.,..))))}}}}.((({(..,{{{|,|||..{{{{....,,,.}}}},,...........((((((((((,,...,(({{((({,..,,.|,|||,,.}}}|((((((((((((.....,,,..(((.(.((((.((,....||||{.,,..{,,,|,.,(((.,,,,||||,.,|{{|,.....{{{{{{{,........)))}}})})}}}}...}))))).).)))......,,..)))))))))))),......,))))}||||||,,,,,,....((((,,(((((.....)))))))))),(,((({{((((,,.||}}||}},||..((((((((.....))))))))...,|}}..,,.....{(((({((((({,{{(((((.,{((({....}}}))}....|||}},,,|,,..,,{||||{{{{.{.{{{|||{{{{{,,,|{{{{,||,,{{|{{{||,},.||{((({{{((({.(({(((.{({((({.{{..((({{{{{{{,|...(((((((.,.(((...{(({((({......,.....}))},,,.,|,,,||}}}})..,.)))..)))))))...|||||.....,,.,,))}..)).)),,)))).,,})))))...}))))})}))))))},,,)}}})..}}))}}))))))}|,{{.|{{}||,.....))}),)}))))).}.}.,))))))))|{{.((((((({{{,..,{,{{...,,,,,,..}}}}}..}}}},,,.((((.((((((((,((....}}|)))))))...)))).,|.}}}}})),})}...(((((,.,.,.(((((((........))))))).....,)})))}}}..,|}))))))||||}|{....}}.}}|}||||||||||,,......,,))))))}{((({{{{{,.......}||||||||,,,.|||||||,..,.{{{({((((((((({{,(({{{{{{{{|||||}|||.||||,.,||||...,...}}))}))))).}}))}|}|{{,||{{((.{{{{,,|....||||,}}}))}(((((.((((((.(..((....))..).)))))).))))),,||||||}}|||||})))},..}}.}}}}||||||}}}}}..{|||}}}|||{.{(((,{{...}}}},}},..),,,))))}),.|{{,({.,,,,,...||,|||{{,,.....,}}|(((......,.))))}})),}}.}))))))}}}}},.,||||||||,{{|||...,|||}|,||||}}}.||{(((.{{,,..,|.|{{..,,,{{{....)))..}}|{(((((.......))))))},.,,|||||{{{{{{{{{..,{{{{{{{{{,..)))).}))))},))))))))))))}}}.....))))|}})))}}}..{((((((.((((((((....(((((.(,((((((((((((((.{(((..(((((((.((((((.({....),))))))))))..)))..)))}.((((.{((((.......}))}.})))}.{{({.{.(((((((((({.(((((.(((((((.,,.,..,,....,)....,,))))))).)))))......,,.....,{{,{((((..(((({({{{({(((({(,......}|||...((((((((.{((({((({..{{{{{..|...,,,,),,)}}})},)}.}).,,))}),)))))))}(((((((((((,{,(((,.||.....,),.),,...,|.(((((((((.((.....)).)))))))))..)))))))))))......,.....)))))),))))))).))))....,,,......,((((((.(((((((,.(((((.((((........)))).....(((((...((.....)).....)))))...))))).,.))))))...}.)))))))))))).)))))}}))}},.,,(((((.(((...)))))))),.)))}}))))))))))..((((((((((...)))))))))).......((((.((((...............))))))))....,,,.....,,)).)))))..)))))))).))))))}(((((.,....,.)))))}{|||...,)))),...}}},{{|||.{{{,.....))).{{{{|||..||,|{{{..,....((((((....{((......))}.))))))...}.}|}|...}}}}}}|(((((.{..((((.......))))..}.)))))).})))}})}))..)))).))))))
Forensic Context
No forensic context available.