Basic Information

Symbol
hsa_HECTD1_0025000
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0031488 hsa_circHECTD1_039 hsa-HECTD1_0041
Host gene
HECTD1
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
14:31602444-31619427 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
14:31133238-31150221 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-489.30 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -532.15 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 635.87
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.....((((((.(((((((.(((.........))).........((((..((......))...))))....(((((((...((((.((((((((.((((...))))))).))))))))).......)))))))(((((((((((((..(((((((((((((...((((....(((((((..((....)).))))))))))).)))))))))))))..........((((...((((.((((...)))).))))...).)))((((((((.(((((....(((.((((...((((...(((.((((((.(((((..((.((..........)).))...)))))..)))))))))))))..)))).)))..(((((..((((.......))))..)))))....................))))).))))))))..((((..(((......)))..)))))))))).))))))).....))).))))))))))...(((((..((((((((((((.(......).)))..........))).)))))).....)))))...((((((((((...((((((((.........))).).))))((((((((((((..........(((.(.((((((((....))))..............((((((((..(((...(((...........)))...)))..)).)))))).((....)))))).).)))..........))))))))))))........))))))))))...((.(((((......)))))))........(((((((......((((..(((.((.(((((..(((((........((((..((((((((((((((....((..(((.(((.(((((((....((((.(((((......(((((((((((.......)))))..(((....))).....))))))))))).))))((...(((((((.(........).)))))))...))....(((((((((((.((((.(((..(..(((((.......((((............)))).....((..(((((((((((((((..(((......((((..(..((((.(((((((.((((..(((.((..((...((...))...)).)).))).))))...)))).))).))))..)..)))).....)))..))))).))))))))))...)).(((((.(((((((((((..(((((...........)))))..))))....((((.((((((((.((....))))))))))...))))....))))))).))))).(((((......(((((((........)))))))......)))))......((((((((((((.((....)).))))((((((((......(((.......)))(((((((((........)))))))))((((.((((((.....((((.(((((((((.((((........))))))))).))))...)))).......)))))))))).))))))))(((((((((.............))))))))).(((((.((((((.(..((....))..).)))))).)))))....))))))))(((((((((.........)))...)))))).((((...((((.((((......))))))))..)))).)))))..)..)))...)))).)))))))))))....))))))).)))..)))..)).....))).)))))))))))((.(((((((..(((........))).))))))).)).(((......))).))))....(((....)))....(((((((.......))))))).......(((((((((((...(((((((((...)))).)))))..))))).)))))).........(((...............))))))))..)))))))..)))..))))....)))))))...
Thermodynamic Ensemble Prediction
,....((((((.(((((((.{((.........))}.,..,||..,(((..,,..}}}.,,..,),})....(((((((...((((.((((({{(.(((,...,)))))).))))))))).......)))))))(((((((((((((,.(((((((((((((...((((....(((((((..((....)).))))))))))).)))))))))))))|..{{{,,,.{(((,..((((.((((,..}}}}.|}}}...},})}{{,(((,,.,,,,.}}}.(({.((((...((((...,,(,((((((.(((((..,({((..........)).))...)))))..)))))),))))))..)))).}}}..{((((..((((.......))))..))))}.,,.......},...,,,},))))).})))))},,.{|||..{{{......))),,)}..))))))}}}))))).....)))})})))))))),..{{(((({((((((((,(((.(...,,,|,|||...,{{....|||.}))),,......,....{,((((((((((...{(((((((,......,.))).).)))|((((((((((((.....,,,..(((.(.((((.((,....||||{.....{,,.,..,(((.,,.,}}||,.,,|||.....,{{{{{{{.........)))))})})}))}...}))))).).)))......},..)))))))))))),.......))))))))))}.....,,...{(((,,(((({.....}))))))))},(,((({{((((...|}}}|}||{{{..((((({{{.....}}}|}}|}.{{{|||,.||...,.,{,{|||,,|||,|,(((((.{{{({{....})))))....))))),,,,,},.,,{{{{{{{{{.{.{{{|||{{|||}},}||||,,,|||||,{,{{,,,.{{((((({(((((.((((((.{((((((.((..((({{,({{{.{...(((((((.,.(((...((({((({............)))},,,.,|,,,||}))))....)))..)))))))...|||||.....,,.,,)))..)).)),,))))...})))))...))))).)})))))}..,{|{|{,.|||||.{|||||,||,,{.|{{}||,.....))}),)}))))).}.|,}}}}}}}|||{{{(((((((,,,,..,,,{{...}}}},,,.}}}}}..}}}}}|,.((((.((((((((.((....}}})))))))...)))).,|,}},}}}}}|}},..{{|||,..,,.{(((({{...,,.,,||||}}}..,,,,}}}}}}}}...((((({{.{(((.((....)).)))}||}||,((((((........)))))),|((({{{{|,.......,||||||||....}}}}})}}..,.,,,(((((((((((({.((((((((((((({||{|{,{{||{.{{({{..,,...,,}},))))).})))}|}|{{{,|{{((.{{{{,,,,...||||,}})))}(((((.((((((.(..((....))..).)))))).))))),,,|||||}||||||||||}|..}|.,}}}||||||}}}}}..{{|||||{(((,((((......}}}}}}}}..}}}}|))||}},|,,{(,.(({{{...{{((({(({{.....,,,{(((......,,)}))..}}})).}))))))))))),,}|{{{{({{{{({,{...,||})}||}}}}}}.||{{{{.{{{{,.,|.{{{..,,,{{{....)))..}}|{(((((.......))))))},...}}}|}{|||{||||..,|||||{|||},.}})).,))))}})))))))))))))))....,))))}}))))))),,)))}}|{|,,,)}))))))),}))))..))}},,,.}},}},,..,
Forensic Context

No forensic context available.