Basic Information

Symbol
hsa_HECTD1_0031100
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0101609 hsa_circHECTD1_008 hsa-HECTD1_0104
Host gene
HECTD1
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
14:31611064-31644344 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
14:31141858-31175138 UCSC (hg38)
External Database
circbank circBase

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-664.10 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -715.75 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 673.72
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((((....)))))).(.(((.((...)).)))..((((((...((((((.((((((((((((.((...(((((.((((.((((((((((.....))))))...(((((.((((....((((((((..((.........)).))))))))...(((.((.((((.(((((((((((....(((((((...((((((.....((((.((((((((((....(((..(((((((.((((((((((((.(((((...))))).).....(((.(......).)))(((((((((((((((((((.(((((((....))).....)))))))))))............(((((((.(((((((.(((...))).))))))).))))).))......)))))..))))))).))))))))))).....(((...((((......))))...)))(((((((((.((((((((.(((............)))((((((((((((....(((...((((((((...((.((((((((((...(((((.(((.(((((.....(((((.(....(((((((((........)))))))))...).)))))......))))).))).)))))))).....))))))))).......(((.((((.(((......)))...)))).)))..))))))))....)))))))))))).))).((((((...(((.((..(((....)))..)))))...)))))).)))))))).))...))))))).))))))).)))((((.....((..(((((((.........(((((((((.(((.((((((.(((.....((..(((((((......))))))).))))))))))).)))...))))))))).........)))))))..)).....)))).)))))))))).)))).....((((((.......))))))(((.(((.(((.(((((((((((.(((((((((((((....(((.(((((......((((.......))))..))))).))).....))).)))))).)))))))))..)))))).)))))))))......))))))................)))))))......))))))))))).)..)))))))).((..(((((((((((((((...(((..(((...)))..)))))))(((((((....)))))))..((((((((.((((.((((....))))..))))))).)))))........(((((((...)))))))(((....)))(((.........)))((((((((........)))))))).....((((.......))))..((((((((...(((((((((((......(((((......(((((.....)))))......)))))....)))))))..))))...))))))))..)))))))))))..)).((((....)))).......)))).)))))......(((((..(((((((((((((((.........((....))...(((((........((((((((.......(((........))).......)))........))))).......)))))..)))))))))))))))..))))).....((((((((((((((.((.(((((((((((..((..((((.....(((((.((.((((((((((((...((((....(((((((..((....)).))))))))))).)))))))))))))).)))))....)))).))..))))).......((((......))))))))))...))...).)))).)))))))))..........((((((.(((((..((.((..........)).))...)))))..)))))))))))))).))))).......))....)))))))))))).))))))..((((((((.(((.((((((.......(((((((.((((.......))))..)))))))..........((((((.....((((.(((....)))..(((((..((((((((((((.(......).)))..........))).)))))).....)))))...((((((((((...((((((((.........))).).))))((((((((((((..........(((.(.((((((((....))))..............((((((((..(((...(((...........)))...)))..)).)))))).((....)))))).).)))..........))))))))))))........)))))))))))))).......(((((.(((((.....)))))))))).))))))(((((...))))).)))))).((((((((.....))))))))..............))).)))))))).....(((((.((((((....))))))....)))))............))))))......).
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((({...,||||}|,,.,({|{,.,||}|||,{{{|||,,,,,((((((.((((((((((((.(({{.(((((.((({.((({((((((.....))))))...(((((.((((....((((((((..{{,,,.,,,..}},}|}}|||}...(((.(,{((((.(((((((((((....(((((((,..,((({{.(({.{(((,((({{{((((,,,.(((,.(((((((.((((((((((({.(((((...))))).,.,{..({|.{......}.)))(((((((((((((((((((.(((((((....))).....)))))))))))...........,(((((((.(((((({.(((...))).})))))).))))).))......)))),.,))))))).))))))))))).....(((...((((......))))...)))((((((((({(((((((,(((({.{((.{{{{{{|{|(((((((({{,{.,,.......,{{{{{,|,,|||}|}}}}}||}({..(((....}}}..}|,..}}}||}||},}}}..((((((((({,.....,,.{{,{{{.{(,,.{((({...{,{{.,,,})}...)))))}),},},))||{|||..,{{{{{,,.,||}}|,|...)}}))}..(((((((((.{........}..)))))))))))))}).})))))||}}}||}}}}}||||}..{{{..{{,..,.,,}))}|{{|||,..,}.)))}.,)))))).))))))}.}}},{,,...,,||,,(((((((.......{{(((((((((.(((.((((((.(((.....{(..(((((((......))))))).})))))))))).)))...))))))))),})......)))))))..},,,,,.||||,|}}}}}}}||.,}}),.,,.|{{{|{....,,.|}}}}},{{.(((.(((.((((({(((((.(((((((((((((....{((,(((({......((((.......))))..))))}.))),,...))),}))))},)))))))))..}))))).))))))))}..,,,.})))}},,,.,}....}}}...})}),.)}}}}..))))))))))).)..)))))))).{(..(((((((((((({((,{,{{{.,(((....))}}}}}}}}}{((((({.,,.}}}}}}|..((((((((.((((.((((....})))..))))))).)))))........{((((((...))))))}(((....)))}{{......,},{|,{(((((({........}))))))).,}{|(,{{,.....{||||..((((,{,(,..{(((((,,,,,...}}}|||,|,.}}}},,|||},.,.})))|,{{{{{|||,,....)))))})}})),,...))))))},.,)))))))))))..)}.{{{|....)))).......)))).)))))...{{.(((((..(((((((((((((((,........,,....))...{((((........{{(({.{{...,,..,.(((.........))}.,..{|,...||...})})).......)))))}.)))))))))))))))..))))).,,..{(((((((((((({.((.((((((({,{{.,{{..{(((.....(((((.(,{((((((((((((...((((....(((((((..((....)).))))))))))).)))))))))))))).)))))....)))}.,|{{|,|||{...}}}|,|}}}...,}}})))))))...))...)}}))).)))))))))..........((((((.(((((..,({((..........)).))...)))))..))))))))))}))).))))).,,....))....)))))))))))).))))))..((((((((..,,.,......,,,..{{.(((((((((((({{((({,,,,{{|,,,,,....,||,,,{{((((.....,,,..,{|{{{{(({..{{{{{..{|,{||}},||}}|...,}..}))),...}}},,.}}},,}}},,.....,,....{,((((((((((...{((({(((,......,.))).).)))|((((((((((((.....,,,..(((.(.((((.((,....||||{.,...{,,.,,.,(((.,,.,}}||,.,,|||.....,{{{{{{{.........)))))})})}))}...}))))).).)))......},..)))))))))))),.......))))))))))}..,,.,,...(((({{(((((.....)))))))))).|}||||(((((...))))),}},}},.|{{(((({.....))))}))))))))))))))))}).}})))))))),..,,{{{{{.{{{({,....,)))))....})))|{{,,||...........}.)),},),
Forensic Context

No forensic context available.