Basic Information

Symbol
hsa_RNU6-541P_0000100
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-HECTD1_0440
Host gene
HECTD1
Type of circRNA
Intergenic-Exon-Intergenic
Location (GRCh37)
14:31605749-31614114 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
14:31136543-31144908 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-121.70 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -133.93 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 115.83
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Forensic Context

No forensic context available.