Basic Information

Symbol
hsa_HECTD1_0004200
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-HECTD1_0260
Host gene
HECTD1
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
14:31574589-31576194 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
14:31105383-31106988 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-109.60 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -119.22 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 153.80
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Forensic Context

No forensic context available.