Basic Information

Symbol
hsa_CHD7_0009500
RNA Class
circRNA
Alias
hsa_circ_0136834 hsa_circCHD7_024 hsa-CHD7_0012
Host gene
CHD7
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
8:61728946-61743136 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
8:60816387-60830577 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-338.2 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -362.5 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 258.1
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((.((((((..(((.((((((.((........((((......))))..((..((.((((..........((((((...(((((((.(((((((......(((((((((((((((((((((.....)))))))))..........((((((((.(((.....))).((((((((((........((.((((.....((((.((.(((.((((.((.(((((((.....))))))...........).)).))))))))).)))).((((((((.((((((............))))))....)).))))))......))))...))..))))))))))))))))))((((((.((((......)))).....(((((...((((................))))..)))))((((((((((((((((......))).))))))))))))).....(((((....))))).))))))((((.(((((..(((((........))))).))))).))))((((...))))....))))))))))))...))))))).)))).....(((((((((.((.((((((((.(((((.(...(((..........)))...)..)))))...).))))))).)).))))).).)))))))))))).((((.(.(((((((((((((....((((....((((((....(((....)))...))))))....))))))))))).((((((.(.......).))))))...)))))).)))))...((((.(((....))).)))))))).))..))......)).)))))).)))))))))..))))...)((.(((.(((((((((((((((..(((((.(((((..((((..((.(((..(..(((...))).)..))).))..))))((((....))))(((((((((((((((((((..((((((((((((.(((((((.((((.((((......)))).))))..))).......)))).).)))))....(((.(((.(((.......)))...))).)))...((((((......))))))........))))))..))..))))))..........))))).))))))........(((....)))......))))))))))))))))..............))))))))).)))(((((((........).)))..)))..............((((((((((((.....)))))))..)))))..........))
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((((((((,..,,(({(..,,,{(({.....}}}}}})}...}))))))))}.,{.((((......,,..,{{|||,..{(({{{{.(((((((......(((((((((((((((((((((.....}})))))))|...,,....((((((((.(((.....))).((((((((((..{.....,,.((((.....((((.((.(((.(({{,{{,|((((((,...,)))))}.....,.,,.}},}},))))))))).)))).((((((((.((((((............))))))....)),})))))......))))...}...)))))))))))))))))){(((({{((((......))))}....{((((...((((................))))..))))|((((((((((((((((......))).))))))))))))),....{(((,....})))}.})}))){(((.(((((,.{((((........))))),))))).)))}((((...))))....))))))))))))...))))))).}}}|,{{..{{(((((((.((.((((((((.(((((,{,..{((..........)))...}..)))))...).))))))).)).))))).).}},))))}}}}|,((({,(.(((((((((((((,...{(({....((,((({...(((....)))...)))))).,..))))))))))).((((((.,.......).)))))}...)))))).})))).,.((((.(((....))).))))))}}{{{{{{|.{({.{..((((....))))..,.,.})),.})))}}.(((.{((((((((((((((..(((((.(((((..((((..(({(((..(..(((...))).,..))).,),,))))((((....))))(((((((((((((((((((..(((((((,,(((.{((,(((.((((.((((......)))).))))..)))......{|||,{(({(((......})}}...}||.}}}}...,|,..,,,.}|||,,{{{{||,.....)))})).}}}..).})))))..,)},}}))))..........)))))},)))))........{{{....)),......))))))))))))))))..............))))))))}.)))((((((,..,.....},)))..})).............,((((((((((((.....)))))))..))))).........,,,
Forensic Context

No forensic context available.