Basic Information

Symbol
hsa_HECTD1_0007600
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-HECTD1_0312
Host gene
HECTD1
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
14:31576773-31590711 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
14:31107567-31121505 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-406.30 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -436.06 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 404.79
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
..((((.((.....(((..(((((.((((((((((((((((((((((.((((((((...))).))))).))((((.((((...)))).)))).))))).)))))))..(((..(((((((((((((.....((.(((.((((((...((......))..((.((((((........)))))).))........)))))).))).))..)))))))).......(((((.((((.(((....))).))))(((....))).))))).........))))))))..(((....((((..((((.((((..((((((.((........))..)))))).(((.(((...))).)))..((((((((((...((.((.((((((((.............))))))))))))..(((((((((.((.(((.((..((((.(((((.((.((.((((((((..(((((...(((((((..(....)..))))))).....)))))......)))).)))))).)).))))))))).))))).)).))))))...)))......((((.((((.((((((.....)))))).))))))))................)))).....)))))).........((((((((..(((((((.(((((......))((((.(........).)))).((((((....))))))......((((..(((((((..((((((((.(.(......).)...))))))))..)))))))..))))(((...))).(((((.((((((((((((.((((((..((...(((((..........)))))...((....(((......)))...)).))..))).))).))))))).))))).)))))))).))))))).)))).......(((.(((((.(.((((.(((.....(((((((......))).))))..(((((((((.......(((((.(((.(((.(((........................((((((..((...((((((..(((...((.(((((((((...))).)))))).(((((...........)))))....................(((.(((((.((((....))))))))).)))....))...)))..))))))..))..))))))((((....))))........(((((.(((((((..........(((.....)))....(((((((((((((.((.....)).))..)))))))))..))..............))))))))))))))))))))).))))).(((((((...((((.((((......)))))).))....))))))))))))))))...........))).))))...).))))).)))...(((((((((.....)))))))))...))))..))))))))..))))...))))))))))).)))))..))).....))))))((((((...)))))).
Thermodynamic Ensemble Prediction
..((((,((....{(((...((((.((((((((((((((((((((((.((((((({...})).))))).))((((.((((...)))).)))).))))).)))))))..(({..{((((.({{(({,,,..,((((({.({,{((({.((((({{,,{..((.((((((........)))))}.}}...,.}.,.))))))),,.})}}))}}))))}}}..}}(((({.((((.(((....))).))))(((....))).))))).........))))))))..{{(....((((..((({,((({,.{((({,.,|,..||||..||||}|.||,{((.(({...})).))),,|||||{.|||}.,||}||,((((((((.......,.,..,}}}||||}||||..(((((((((.({.(((,((...,,{,{((((,((,{(({{{,,,||},||,||,,.,{{{{{,..,....}.{|||,|||....})),))}}.},.},,),))))}}}},.)))))}}||{|}},..})}},,}},...}}}......((({{((((.((((((.....)))))).)))))))}{{{...,.........))}|.,...,|||||.{,,..,,.{(({({{{..{{(((({.{{{{|,||||||}((((.{{,......,,}))).((((({....))))))......((((..(((((({,,((((((((.{.,......).,...)))))))).,)))))))..))))({{...,)),|((((,{(((((((((((.((((((..({...{((((..........))))}...{(....(((......)))...)).})..))).))).)))))))))),})})))})}}).})}))}}.}}}}..,..,,|||,|||||.|.{|||.|||..,..,{{((({,,,...))),}}}|..(({{((((({,,....(((((.(((.(({,(((,,......................((((((..((...((((((..(((...((.(((((({({...})).)))))).(((((,,,,.....,,))))),...((((..{(((.,,....,,,,)))}...)))}|||.|||,,,,.,,}},.,))...)))..))))))..))..))))))((((....))))...}}},.(((((.(((((((..........{((.....))),,..{{(((((((((((.((,...,)).))..)))))))))..}}.,......,,....)))))))))))),,})))))).))))).|||||||,..||||,((((......))))}},)}....))}})}}|))}))}}}..,,,,,.,,,))}.,))),,,),))))),))}|,,(((((((((.....)))))))))},.}},}..})))))))..))))...))))))))))).)))))}}),,...,,))))))((((((...)))))).
Forensic Context

No forensic context available.