Basic Information

Symbol
hsa_HECTD1_0007800
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-HECTD1_0414
Host gene
HECTD1
Type of circRNA
Intron-Exon-Intron
Location (GRCh37)
14:31578515-31590711 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
14:31109309-31121505 UCSC (hg38)
External Database
circbank

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-381.30 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -410.21 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 342.05
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.(((((((((.......(((((..(.((((..(((((((((((((((.((((((((...))).))))).))((((.((((...)))).)))).))))).)))))))).....)))).).))))).......(((((..((..((((..((((....(((((.((((.((((((.(.....((((..((((.....))))..)))).((((((((....((...(((((.((((.(((....))).))))(((....))).)))))......))....))))))))).)))))).((..(((....)))..))..)))).)))))...))))..)))).))..)))))...........)))))))))(((((.....))))).......((((((((.((((..((((...((((((((((.((((((...((((.((((((((.((......)))))).)))).................((((.(((....))).)))).))))..)))))).))...))))))))..)))).........)))).))).....)))))(((((.((((((.....)))))).)))))((((((..(((((((((((((.(((..(.(((((.((((.((..((.((((..(((((((.(((((......))((((.(........).)))).((((((....))))))......((((..(((((((..((((((((.(.(......).)...))))))))..)))))))..))))(((...))).(((((.((((((((((((.((((((..((...(((((..........)))))...((....(((......)))...)).))..))).))).))))))).))))).)))))))).))))))).)))).))..))))))))))).)..)))..((((((((((((((......))).)))..(((..(((((((((...(((((.(((.(((.(((........................((((((..((...((((((..(((...((.(((((((((...))).)))))).(((((...........)))))....................(((.(((((.((((....))))))))).)))....))...)))..))))))..))..))))))((((....))))........(((((.(((((((..........(((.....)))....(((((((((((((.((.....)).))..)))))))))..))..............))))))))))))))))))))).))))))))))))))..)))..((((......))))(((.....))).)))))))))))))).))).......))))..))))))..((((((..((((...(((......)))...))))...))).)))(((........)))
Thermodynamic Ensemble Prediction
.(((((((((.,,....(((((..(.((((,.(((((((((((((((.((((((({...})).))))).))((((.((((...)))).)))).))))).)))))))).....))))},.))))).......(((({..{,..((((..((((..{.(((((.((((.,(((.........{{((...{(({,,,,||}|||||,,.((((((((....,{,,.({{{{.{(((.(((....))).))))|||....))).)))))......,,....}})))}}}.,|{,|||.||,.{||,,,.,}}.}))..)))).))))).,.))))..)))),))}.}}}}}....,.....,}}})))}}}.{{{{,,((((((((............,}}}))))}}|||..(((((((((.((.(((,((...,,{,{((((,((,{(({{{,,,||,,||{||,..,{{{{{,..{....}.{|||,|||....})),)),}.},.},,),))))}}}}}.)))))}}}|,|}}},.}),}}}}},...}}}......{(({{((((.((((((.....)))))).)))))))|,{{..,{,{{{{{(((({.{((..(.(((((.((({,((..((.((((..(((((((.((((,,,,,,,|,((((.,,.......,,)))).((((({....)))))),.,...((((..(((((({,,((((((((.{.,......).,...)))))))).,)))))))..))))(({...})).{((((,{{((((((((((.((((((..((...{((((..........))))}...{(....(((......)))...)).))..))).))).)))))))))),})})))})))).))))))).)))).}}..))))))))))).}..}}}..{{{{{{{{{{((((......))).))|{.{((..(((((((({...(((((.(((.(({.(((,,......................((((((..((...((((((..(((...((.(((((({({...})).)))))).(((((.,,,.....,.))))),...((({..{{({.,,....,,,,)}}}...)))}|||,|||,,,,.,,)},.,))...)))..))))))..))..))))))((((....))))...}}},.(((((.(((((((..........{((.....))),,..{{(((((((((((.((,...,)).))..)))))))))..}}.,......,,....))))))))))))}}})))))).))))))))))))))..)))},{(((......))))|{|.....}}}.)))))))})))}}},}}},......,,}},,}|}}}}..((((({..((((.,.(((......))).,.))))...))).))),,,........))}
Forensic Context

No forensic context available.